Иако су постојале одређене академије (филозофска и теолошка) установљене су у 17. веку, универзитет је прво отворен са именом фр.Écoles centrales, 1810. док је Љубљана била део Илирских провинца, мада је убрзо била укињена када је Аустрија повратила то земљиште.
По изгласавању закона o универзитету у Љубљани је прво установљени факултети за Права, Филозофију, Технику, Теологију и Медицину. Много заслуга за оснивање универзитета има Михајло Ростохар. У јулу 1919 у привременом народном представништву у Београду, je 31. августa именовано првих 18 професора, који су вечином стигли из странства.[2][3] Званично је универзитет установљен 1. септембра 1919.[4] 12. новембра су били изгласани ректор (као први био је математик Јосип Племeљ)[3] и декани, а 3. децембра је одржано прво предавање.[5] У првој години рада (1919/1920) је универзитет уписало 942 студената. Од тога 28 жена и 914 мушкараца. У школској години 2007/2008 уписао се 47.465 студената.[6]