FYVE domen

FYVE cinkov prst

Rani endozomni antigen 1 (EEA1), dimer sa lipidima.[1]
Identifikatori
Simbol	FYVE
Pfam	PF01363
InterPro	IPR000306
PROSITE	PDOC50178
SCOP	1vfy
Superfamilija	1vfy
OPM protein	62
OPM protein	1vfy
Dostupne PDB strukture: Pfam structures PDB RCSB PDB; PDBe PDBsum strukturni pregled

U molekularnoj biologiji FYVE cinkov prst domen je dobio ime po grupi od četiri proteina bogatih cisteinom: Fab 1 (kvaščani ortolog proteina PIKfyve), YOTB, Vac 1 (transportni protein vezikula), i EEA1, kod kojih je nađen. FYVE domeni vezuju fosfatidilinozitol 3-fosfat,^[2] na način koji je zavistan od od koordinacije metalnih jona i od baznih aminokiselina. FYVE domen se umeće u ćelijske membrane na način koji je zavistan od pH vrednosti.^[3] Ovaj domen učestvuje u vakuolarnom sortiranju proteina i funkcionisanju endozoma.^[4]

Struktura

FYVE domen se sastoji od dve male beta ukosnice (ili cinkova zglavka) čemu sledi alfa heliks.^[5] FYVE prst vezuje dva jona cinka. On ima osam pozicija koje potencijalno mogu da sadrže cink, i karakterističan je po tome što ima bazne aminokiseline oko cisteina. Mnogi članovi ove familije takođe sadrže dva histidina u motivu:

R+HHC+XCG, gde + označava naelektrisane ostatke, a X bilo koji ostatak

FYVE prst je strukturno sličan sa RING domenom i PHD prstom.

Primeri

Sledeći ljudski proteini sadrže FYVE domen:

• ANKFY1, EEA1 FGD1, FGD2, FGD3, FGD4, FGD5, FGD6, FYCO1, HGS MTMR3, MTMR4, PIKFYVE, PLEKHF1, PLEKHF2
• RUFY1, RUFY2, WDF3, WDFY1, WDFY2, WDFY3, ZFYVE1, ZFYVE16, ZFYVE19, ZFYVE20, ZFYVE21, ZFYVE26, ZFYVE27, ZFYVE28, ZFYVE9

Reference

1. Dumas JJ, Merithew E, Sudharshan E, et al. (November 2001). „Multivalent endosome targeting by homodimeric EEA1”. Mol. Cell 8 (5): 947–58. DOI:10.1016/S1097-2765(01)00385-9. PMID 11741531. 
2. Gaullier JM, Simonsen A, D'Arrigo A, Bremnes B, Stenmark H, Aasland R (July 1998). „FYVE fingers bind PtdIns(3)P”. Nature 394 (6692): 432–3. DOI:10.1038/28767. PMID 9697764. 
3. He J, Vora M, Haney RM, et al. (September 2009). „Membrane insertion of the FYVE domain is modulated by pH”. Proteins 76 (4): 852–60. DOI:10.1002/prot.22392. PMC 2909462. PMID 19296456. 
4. Leevers SJ, Vanhaesebroeck B, Waterfield MD (April 1999). „Signalling through phosphoinositide 3-kinases: the lipids take centre stage”. Curr. Opin. Cell Biol. 11 (2): 219–25. DOI:10.1016/S0955-0674(99)80029-5. PMID 10209156. 
5. Misra S, Hurley JH (May 1999). „Crystal structure of a phosphatidylinositol 3-phosphate-specific membrane-targeting motif, the FYVE domain of Vps27p”. Cell 97 (5): 657–66. DOI:10.1016/S0092-8674(00)80776-X. PMID 10367894. 

Literatura

• Stenmark H, Aasland R, Toh BH, D'Arrigo A (September 1996). „Endosomal localization of the autoantigen EEA1 is mediated by a zinc-binding FYVE finger”. J. Biol. Chem. 271 (39): 24048–54. PMID 8798641. 
• Stenmark H, Aasland R (December 1999). „FYVE-finger proteins--effectors of an inositol lipid”. J. Cell. Sci. 112 (Pt 23): 4175–83. PMID 10564636.