С началом войны части дивизии в составе Юго-Западного фронта участвовали в приграничном сражении, в ожесточенных оборонительных боях в районе пгт Липканы (Молдавия) и на реке Днестр на участке Студеница, Камос. Со 2 августа дивизия входила в 18-ю армиюЮжного фронта и под ударами превосходящих сил противника вынуждена была отходить в направлении Каменец-Подольска, Первомайска, затем сдерживала передовые части противника на промежуточных рубежах в районах Боштанка, Нижнеднепровск. К 13 сентября 169-я стрелковая дивизия была выведена из боя и переброшена в район Полтавы, где в составе 38-й армииЮго-Западного фронта отражала наступление противника на харьковском направлении. В дальнейшем с этой же армией вела оборонительные бои на реке Северский Донец. С ноября 1941 года по февраль 1942 года майор Краснов находился в госпитале в городе Саратов, затем был назначен начальником штаба формировавшейся в ПриВО136-й отдельной стрелковой бригады. В том же месяце она убыла на Калининский фронт в 30-ю армию и участвовала в битве под Москвой. С 13 апреля 1942 года Краснов вступил в командование этой бригадой. Летом в составе той же армии участвовал с ней в Ржевско-Сычёвской наступательной операции. В сентябре — октябре 1942 года бригада находилась в непосредственном подчинении командования фронта, затем была передана 39-й армии и участвовала в операции «Марс». В марте 1943 года принимала участие в Ржевско-Вяземской наступательной операции[3].
В середине мая в районе Ржева в составе 68-й армии резерва Ставки ВГК была сформирована 153-я стрелковая дивизия, полковник Краснов утвержден ее командиром. С 12 июля она вместе с армией была включена в Западный фронт, затем с 4 августа передана 5-й армии и участвовала с ней в Смоленской, Спас-Деменской наступательных операциях. С 24 августа входила в 21-ю армию и успешно действовала в Ельнинско-Дорогобужской и Смоленско-Рославльской наступательных операциях. 22 сентября ее части перерезали ж. д. Смоленск — Рославль в 30 км юго-восточнее Смоленска и тем самым оказали помощь частям, освобождавшим город. За отличия в этих боях приказом ВГК от 25.09.1943 дивизии было присвоено почетное наименование «Смоленская ». С 21 октября она перешла в состав 33-й армии, затем с 8 декабря вновь была передана 5-й армии и вела бои на витебском направлении[3].
Приказы (благодарности) Верховного Главнокомандующего в которых отмечен Н. И. Краснов[4].
За форсирование реки Днепр и овладение штурмом крупным областным центром городом Смоленск — важнейшим стратегическим узлом обороны немцев на Западном направлении. 25 сентября 1943 года № 25.
За овладение штурмом крепостью и главным городом Восточной Пруссии Кёнигсберг — стратегически важным узлом обороны немцев на Балтийском море. 9 апреля 1945 года. № 333.
Коллектив авторов. Великая Отечественная: Комдивы. Военный биографический словарь. Командиры стрелковых, горнострелковых дивизий, крымских, полярных, петрозаводских дивизий, дивизий ребольского направления, истребительных дивизий. (Ибянский — Печененко). — М.: Кучково поле, 2015. — Т. 4. — С. 417—419. — 330 экз. — ISBN 978-5-9950-0602-2.
Коллектив авторов: к.и.н. М.Э. Морозов (руководитель), к.и.н. В.Т. Елисеев, к.и.н. К.Л. Кулагин, С.А. Липатов, к.и.н. Б.Н. Петров, к.и.н. А.А. Черняев, к.и.н. А.А. Шабаев. Великая Отечественная война 1941-1945 гг. Кампании и стратегические операции в цифрах. В 2-х томах. — М.: Объединённая редакция МВД России, 2010. — Т. 2. — 608 с. — 1000 экз. — ISBN 978-5-8129-0099-1.