Маршрут R действует круглосуточно. Обычно он проходит от Форест-Хилс — 71-я авеню в Куинсе до Бей-Ридж — 95-я улица в Бруклине. Ночью поезда R ходят от Уайтхолл-стрит на юге Манхэттена до своей обычной южной конечной станции в Бруклине. Кроме того, один рейс, идущий из Бруклина в будни, в утренние часы пик, следует до 96-й улицы в Манхэттене (конечной маршрута Q).
R — самый длинный маршрут, который на всём своём протяжении проходит под землёй. Всего в системе три таких маршрута — C, S (42nd Street) и R (хотя существует короткий наземный участок между 59th Street и Bay Ridge Avenue в Бруклине, где линия проходит над путями LIRR).
В народе линия называется Silicon Subway, что связано с её социальной ролью, так как маршрутом пользуются рабочие промзоны Бруклина (около Ист-Ривер). Маршрут проходит две одноимённые станции на своем пути следования — 36-я улица и 36-я улица.
В зимний период 1960—1961 годов на картах стали появляться логотипы RR, маршрут которого был известен, как «Fourth Avenue Local via Tunnel». Движение RR абсолютно ничем не отличался от сегодняшнего R. С 27 ноября1967 года, на следующий день после открытия нового соединения IND Chrystie Street, RR был переведен обратно на Astoria — Ditmars Boulevard по BMT Astoria Line (в это время введенный ЕЕ следовал от Whitehall Street до 71st Avenue). В это же время появился новый маршрут — RJ, который следовал от 95th Street до 168th Street (в Куинсе). Логотип RR перекрасили в зелёный цвет, в то время, как RJ стал красным.
RJ проработал всего лишь несколько месяцев, а затем укорочен до Chambers Street. Маршрут стал работать только в часы пик в пиковом направлении. В мае 1985 года, когда двухбуквенные обозначения были сняты, RR был переименован в R, а логотип перекрашен в жёлтый (так как использовал BMT Broadway Line) а некоторые также в коричневый (до Chambers Street).
С 24 мая1987 годаN и R поменялись своими конечными станциями, и R снова стал следовать по IND Queens Boulevard Line до Forest Hills. Это изменение было сделано для того, чтобы дать R прямой доступ к депо Jamaica Yard (туда, где поезда отстаиваются и по сей день). Раньше поезда R «ночевали» в депо Coney Island Yard. Полгода позже был ликвидирован «коричневый R» до Chambers Street.
Очередные изменения коснулись этого маршрута 29 октября2012 года, когда к городу подступал ураган «Сэнди», вследствие чего этот маршрут был закрыт, как и вся система метро. В результате урагана была затоплена значительная часть линий, по которым пролегал данный маршрут. Восстановление движения поездов по маршруту R после урагана было на двух участках, не связанных между собой: между станциями Форест-Хилс — 71-я авеню и 34-я улица — Геральд-сквер на северном (в Манхэттене и Куинсе), и между Джей-стрит — Метротек и Бей-Ридж — 95-я улица на южном (в Бруклине). 4 декабря северная часть маршрута была продлена до Нижнего Манхэттена — до станции Уайтхолл-стрит — Саут-Ферри. Обе части маршрута были соединены 21 декабря2012 года, после завершения работ в тоннеле Монтегью-стрит.
Проведённые в ноябре-декабре 2012 года ремонтные работы в тоннеле Монтегью-стрит производились в срочном порядке, когда основной задачей было восстановление единого маршрута R. Поэтому тоннель со 2 августа2013 года по 14 сентября2014 года был вновь закрыт на капитальный ремонт, что повлекло деление маршрута R по будням на две части: в Куинсе и Манхэттене на участке от Форест-Хилс — 71-й авеню до Уайтхолл-стрит — Саут-Ферри, а в Бруклине на участке от Корт-стрит до Бей-Ридж — 95-й улицы. По выходным дням маршрут сохранялся с проходом проблемного участка через Манхэттенский мост без обслуживания станций Нижнего Манхэттена.
С ноября 2016 года ночной R продлён до Уайтхолл-стрит.
Маршрут
Используемые пути в зависимости от дня недели и времени суток
↑Переход требует выхода из метро и повторного входа через турникет, но бесплатный для пассажиров, оплачивающих проезд при помощи MetroCard[англ.] или OMNY[англ.].
