BioRxiv

bioRxiv
Изображение логотипа
URL biorxiv.org
Коммерческий Нет
Тип сайта Наука
Язык (-и) Английский
Владелец Лаборатория в Колд-Спринг-Харбор
Создатель Ричард Север, Джон Инглис
Начало работы ноябрь 2013; 11 лет назад (2013-11)
Страна

bioRxiv (произносится как «био(а)рхи́в») — бесплатный электронный архив научных статей и препринтов по биологии, созданный в 2013 году сотрудниками Лаборатории в Колд-Спринг-Харбор Ричардом Севером и Джоном Инглисом по аналогу с уже набравшим популярность arXiv.org.

Авторы публикуют на bioRxiv ранее не рецензированные работы, чтобы получить фидбэк от других участников портала или утвердить первенство открытия. Перед публикацией рукописи не рецензируются, однако проходят первичную проверку модераторов на плагиат. Около 30 % авторов впоследствии размещают на портале отредактированные с учётом полученных комментариев версии. Большинство представленных на bioRxiv рукописей в результате публикуются в рецензируемых журналах.

На ноябрь 2021 года на портале было размещено более 140 000 работ.

История

BioRxiv был запущен на волне популярности онлайн-репозиториев препринтов, первым из которых стал созданный физиком из Лос-Аламосской национальной лаборатории Полом Гинспаргом в 1991 году портал ArXiv.org (произносится как [архи́в]). К моменту создания arXiv практика обмена препринтами в области физики была достаточно распространена — исследователи успешно рассылали друг другу свои неопубликованные отчёты об экспериментах или черновые версии статей до публикации в журнале. Такой обмен позволял не только получить комментарии и критику коллег перед рецензированием, но и предотвратить дублирование данных или закрепить первенство открытия[2][3]. Вскоре arXiv получил широкую популярность и к июлю 2021 года на сайте было размещено около 1,9 млн работ[4].

Изначально arXiv.org принимал работы исключительно в области физики, однако с повышением спроса и на другие отрасли наук, в 2003 году Гинспарг инициировал создание отдельной секции для загрузки препринтов по количественной биологии, включая биологическую статистику, биоинформатику, популяционную биологию. Одновременно с этим отдельный раздел для препринтов по биологии открыл и журнал открытого доступа PeerJ[англ.]. Однако несмотря на растущую популярность этих секций в репозиториях (размещённые в arXiv работы по биологии впоследствии были опубликованы в Nature и PLOS Biology), порталы не стремились к дальнейшему расширению возможностей для публикаций работ в этой сфере[5][6].

В 2013 году молекулярный биолог Ричард Север из Лаборатории в Колд-Спринг-Харбор (CSHL) вместе с коллегой Джоном Инглисом запустили аналогичный arXiv портал под названием bioRxiv на основе хостинга HighWire[англ.][7][5]. BioRxiv был официально аффилирован с CSHL[8], а главными целями были заявлены ускорение процесса распространения знания и предоставления возможностей для получения критических комментариев и отзывов на ещё не опубликованные работы в области биологии[9]. Только за первый год работы на портал было загружено 800 препринтов[10], а всего за период с 2013 по 2016 год — около 3000 работ[11]. К 2019-му их количество увеличилось до 40 000[12]. На ноябрь 2021 года портал содержит данные о более чем 140 000 препринтов[13].

В 2016 году bioRxiv подписал соглашение с Biophysical Journal[англ.], ELife, The EMBO Journal, EMBO Molecular Medicine[англ.], EMBO Reports[англ.], G3: Genes, Genomes, Genetics[англ.], Molecular Systems Biology[англ.], согласно которому авторы опубликованных на портале препринтов могут отправлять свои статьи на рецензию напрямую через bioRxiv без необходимости заново загружать файлы и повторно вводить информацию на сайте журнала[11].

Консультативный совет bioRxiv включает, среди прочих, создателя arXiv Пола Гинспарга и соучредителя Академии Google Анурага Ачарья[англ.][9].

Принцип работы

Для размещения на bioRxiv допускаются только рукописи, ранее не опубликованные в научных журналах и не проходившие рецензирование. При публикации статьи авторы могут охарактеризовать свою работу как новую, подтверждающую или опровергающую уже существующие научные исследования, а также выбрать одну из 26 тематических категорий. После подачи статьи модераторы проверяют её на наличие оскорбительного или ненаучного содержания, однако не редактируют и не рецензируют сам текст. Как правило, статьи становятся общедоступными в течение нескольких часов после загрузки[14]. Впоследствии исследователи могут как публиковать исправленные версии работы, так и добавлять ссылки на журнальные публикации препринта[9].

Каждому препринту присваивается DOI, который вместе с другими альтметрическими и данными о количестве PDF-загрузок доступны для всех пользователей. В случае публикации препринта в качестве статьи в научном журнале, bioRxiv обновляет старую версию ссылкой на публикацию. Статьи на bioRxiv индексируются поисковой системой Google и Академией Google, однако не включены в систему PubMed, в которой хранятся только рецензированные материалы[14].

На 2016 год большинство опубликованных на bioRxiv работ были по эволюционной биологии, генетике и геномике[14].

BioRxiv принимает препринты статей, охватывающие все аспекты исследований по биологии. При размещении статьи автор относит её к одной из следующих категорий[15]:

Влияние

В 2019 году исследователи проанализировали 7087 размещённых на bioRxiv работ и сравнили альтметрические показатели с недепонированными статьями. Результаты показали, что опубликованные в bioRxiv препринты цитировались в среднем на 36 % чаще и имели на 49 % более высокие альтметрические показатели[16]. Полученные данные свидетельствуют о долговременном положительном влиянии публикации препринтов на количество цитирований, а не только на скорость их появления, как до этого было доказано в анализе работ, размещённых на arXiv.org[16][17][16].

Около 30 % опубликованных на bioRxiv препринтов остаются неопубликованными в журналах — аналогичные данные были получены и при анализе публикационной активности на arXiv. При этом почти половина впоследствии опубликованных препринтов bioRxiv появляется в журналах Elsevier, Nature, Public Library of Science и Издательстве Оксфордского университета[12]. BioRxiv наиболее популярен среди исследователей из США и Великобритании, гораздо меньшей популярностью он пользуется в Китае, России и Турции[18].

Примечания

  1. WorldCat (мн.) — 1971.
  2. Pinfield, 2001.
  3. Vivienne Bachelet. What are preprints? Medwave (2017). Дата обращения: 1 мая 2021. Архивировано 11 мая 2021 года.
  4. Monthly Submissions. Cornell University. Дата обращения: 2021-04-37. Архивировано 7 мая 2021 года.
  5. 1 2 Ewen Callaway. Preprints come to life. Nature (12 ноября 2013). Дата обращения: 2 июля 2021. Архивировано 15 декабря 2021 года.
  6. Ewen Callaway. Geneticists eye the potential of arXiv. Nature (31 июля 2012). Дата обращения: 29 июня 2021. Архивировано 11 августа 2021 года.
  7. HighWire at 25: Richard Sever (bioRxiv) looks back. High Wire (12 августа 2020). Дата обращения: 5 июля 2021. Архивировано 9 июля 2021 года.
  8. The preprint server for biology. CSHL (12 ноября 2013). Дата обращения: 3 июля 2021. Архивировано 9 июля 2021 года.
  9. 1 2 3 Jocelyn Kaiser. New Preprint Server Aims to Be Biologists' Answer to Physicists' arXiv. Science (12 ноября 2013). Дата обращения: 28 июня 2021. Архивировано 9 июля 2021 года.
  10. Jocelyn Kaiser. BioRxiv at 1 year: A promising start. Science (11 ноября 2014). Дата обращения: 29 июня 2021. Архивировано 28 июля 2021 года.
  11. 1 2 bioRxiv preprints can now be submitted directly to leading research journals. Physics org (15 января 2016). Дата обращения: 29 июня 2021. Архивировано 18 марта 2018 года.
  12. 1 2 Anderson, 2019.
  13. All Articles. BioRxiv. Дата обращения: 22 ноября 2021. Архивировано 21 ноября 2021 года.
  14. 1 2 3 John Sever. bioRxiv: a progress report. ASAPbio. Дата обращения: 29 июня 2021. Архивировано 9 июля 2021 года.
  15. About bioRxiv. bioRxiv. Дата обращения: 3 июля 2021. Архивировано 1 декабря 2018 года.
  16. 1 2 3 Fraser, 2020, с. 618—636.
  17. Gemma Conroy. Preprints boost article citations and mentions. Nature Index (9 июля 2019). Дата обращения: 3 июля 2021. Архивировано 9 июля 2021 года.
  18. Abdill, 2020.

Литература

Ссылки

Read other articles:

Indonesian musician K. P. H. Notoprojo Kanjeng Pangeran Harjo Notoprojo (Aksara Jawa: ꦑꦤ꧀ꦗꦼꦁꦦꦔꦺꦫꦤ꧀ꦲꦂꦗꦟꦡꦦꦿꦗ), also known as Tjokrowasito, Wasitodipuro, Wasitodiningrat, among other names (March 17, 1909 – August 30, 2007), was one of the most highly respected performers of Javanese gamelan. He led the Paku Alaman palace gamelan as well as the gamelan for the Radio Republik Indonesia Yogyakarta, and taught gamelan in universities around the world. He wa...

 

For the suburb in Brisbane, see Ascot, Queensland. Mount Sibley, Queensland redirects here. For the mountain, see Mount Sibley (Queensland). Map all coordinates using: OpenStreetMap Download coordinates as: KML GPX (all coordinates) GPX (primary coordinates) GPX (secondary coordinates) Suburb of Toowoomba Region, Queensland, AustraliaAscotQueenslandFarm building at Ascot, 2014AscotCoordinates27°48′55″S 152°00′04″E / 27.8152°S 152.0011°E / -27.8152; 152.0011...

 

xts Đường cao tốc Bắc – Nam phía Tây (Bắc) Tuyên Quang – Phú Thọ Phú Thọ – Ba Vì Ba Vì – Chợ Bến¹ Chợ Bến – Thạch Quảng Thạch Quảng – Tân Kỳ Tân Kỳ – Tri Lễ Tri Lễ – Rộ Rộ – Vinh² Vinh – Bãi Vọt³ Bãi Vọt – Hàm Nghi³ Hàm Nghi – Vũng Áng³ Vũng Áng – Bùng³ Bùng – Vạn Ninh³ Vạn Ninh – Cam Lộ³ Cam Lộ – La Sơn³ La Sơn – Túy Loan³ Đà Nẵng – Ngọc Hồi⁴ Ngọc Hồi – Pl...

Truce of Bruges (1375)TypeTime-limited truceContextHundred Years' WarSigned27 June 1375, extended on 12 March 1376LocationBrugesExpiration24 June 1377Signatories John of Gaunt Philip the Bold Parties Kingdom of England Kingdom of France The treaty of Bruges of 1375 (also known as the truce of Bruges) was a truce between the Kingdoms of England and France during the Hundred Years' War. It was signed on 27 June 1375 for one year, then extended on 12 March 1376 to 24 June 1377. King Charles V of...

 

Public park in California Tilden Regional ParkEastern entrance at Inspiration PointTilden Regional ParkShow map of Oakland, CaliforniaTilden Regional ParkShow map of CaliforniaTilden Regional ParkShow map of the United StatesLocationBerkeley HillsCoordinates37°53′41″N 122°14′30″W / 37.8946474°N 122.2416352°W / 37.8946474; -122.2416352[1]Area2,079-acre (841 ha)Created1936Operated byEast Bay Regional Park District Charles Lee Tilden Regional...

 

American TV anthology series (1957–1960) Alcoa TheatreDeForest Kelley on Alcoa Theatre 1960GenreAnthologyWritten byBob BarbashFrederick Brady Fred FreibergerLeonard FreemanFred F. FinklehoffeChristopher KnopfRuth McKenneyStirling SilliphantGeorge F. SlavinDirected byRobert FloreyAlvin GanzerTay GarnettByron HaskinPaul HenreidDon McDougallRobert Ellis MillerDon SiegelDavid SwiftDon TaylorDon WeisPaul WendkosStarringDavid NivenRobert RyanJane PowellJack LemmonCharles BoyerTheme music com...

2010 Indian filmVallakottaiTheatrical release posterDirected byA. VenkateshWritten byRafi-MecartinProduced byT. D. RajaStarringArjunHaripriyaAshish Vidyarthi Ganja KaruppuSathyanCinematographyAnjiEdited byKay KayMusic byDhinaRelease date 5 November 2010 (2010-11-05) Running time135 minutesCountryIndiaLanguageTamil Vallakottai is a 2010 Indian Tamil-language superhero film directed by A. Venkatesh. A remake of the 2007 Malayalam film Mayavi,[1] the film stars Arjun and H...

 

Álvaro Arzú EscobarPresiden Kongres GuatemalaMasa jabatan14 Januari 2018 – 14 Januari 2020PendahuluÓscar ChinchillaPenggantiAllan Estuardo RodríguezAngota Kongres GuatemalaPetahanaMulai menjabat 14 Januari 2016Daerah pemilihanDaftar Nasional Informasi pribadiLahirÁlvaro Enrique Arzú Escobar27 Februari 1985 (umur 38)Kota GuatemalaPartai politikPartai UnionisPendidikanUniversidad Francisco MarroquínSunting kotak info • L • B Álvaro Arzú Escobar (lahir ...

 

2016 Indian Hindi-language historical action drama film Not to be confused with 10/31 (film). 31st OctoberPromotional release posterDirected byShivaji Lotan PatilWritten byAmit TuliHarry SachdevaProduced byHarry SachdevaStarringSoha Ali KhanVir DasLakha Lakhwinder SinghPritam KagneCinematographyRamani Ranjan DasRelease dates 29 September 2015 (2015-09-29) (Vancouver International Film Festival) 21 October 2016 (2016-10-21) CountryIndiaLanguageHindi 31st Octob...

Konferensi YaltaYalta ConferenceCrimean ConferenceArgonaut ConferenceTiga Besar saat Konferensi Yalta, Winston Churchill, Franklin D. Roosevelt and Joseph Stalin. Di belakang mereka berdiri, dari kiri. Marsekal lapangan Sir Alan Brooke, Laksamana Besar Ernest King, Laksamana William D. Leahy, Jenderal George Marshall, Mayor Jenderal Laurence S. Kuter, Jenderal Aleksei Antanov, Laksamana Madya Stepan Kucherov, dan Laksamana Besar Nikolay Kuznetsov.Tuan rumah Uni SovietTanggal4–11 Februa...

 

National Park in Malaysia Niah CavesThe main entrance to the Niah Caves at sunsetLocation in MalaysiaShow map of BorneoNiah Caves (Malaysia)Show map of MalaysiaCoordinates3°48′50″N 113°46′53″E / 3.81389°N 113.78139°E / 3.81389; 113.78139Discovery1950Entrances1 Niah Caves An archaeological site at the Painted Cave (Kain Hitam). Painted Cave is a small but archaeologically significant cave located south of the Niah Great Cave complex where ancient burial site...

 

Pour les articles homonymes, voir Zelaya. Manuel Zelaya Manuel Zelaya en 2022. Fonctions Conjoint de la présidente du Honduras (en) En fonction depuis le 27 janvier 2022(1 an, 10 mois et 11 jours) Présidente Xiomara Castro Prédécesseur Ana García Carías (en) Président de la République du Honduras 27 janvier 2006 – 27 janvier 2010[N 1](4 ans) Élection 27 novembre 2005 Vice-président Elvin Santos OrdóñezArístides Mejía Prédécesseur Ricardo Maduro ...

Chief Minister of West Bengal, India since 2011 Mamata redirects here. For other uses, see Mamata (disambiguation). Mamata BanerjeeOfficial portrait, 20158th Chief Minister of West BengalIncumbentAssumed office 20 May 2011 (2011-05-20)GovernorM. K. NarayananD. Y. PatilKeshari Nath TripathiJagdeep DhankharLa. GanesanC. V. Ananda BoseCabinetBanerjee ministry - IIIBanerjee ministry - IIBanerjee ministry - IPreceded byBuddhadeb Bhattacharjee Additional ministries IncumbentAssum...

 

جامعة لوزان Université de Lausanne   معلومات التأسيس 1537  الموقع الجغرافي إحداثيات 46°31′21″N 6°34′46″E / 46.5225°N 6.5794444444444°E / 46.5225; 6.5794444444444  البلد سويسرا  إحصاءات عدد الطلاب 13,500 (2014) (سنة ؟؟) عضوية أورسيد  [لغات أخرى]‏ (أكتوبر 2023)[1][2]رابطة الجامعات الأور�...

 

كرونة سويديةsvensk kronaمعلومات عامةالبلد السويدتاريخ الإصدار 1874رمز العملة krرمز الأيزو 4217 SEKالمصرف المركزي سفيريجيز ريكسبانكدار سك العملة Tumba Bruk (en) — Mint of Finland (en) سعر الصرف 0٫09718 يورو (23 مايو 2018) تعديل - تعديل مصدري - تعديل ويكي بيانات الكرونة السويدية (بالسويديّة: svensk krona) العملة ا...

French diplomat (born 1944) Bernard BoursicotBoursicot's passport photo circa 1960Born (1944-08-12) 12 August 1944 (age 79)NationalityFrenchOccupationDiplomatPartnersShi Pei Pu (beginning 1964)Thierry Toulet (beginning 1974)ChildrenShi Dudu (Bertrand) Bernard Boursicot (born 12 August 1944) is a French diplomat who was caught in a Chinese honeypot trap (seducing him to participate in espionage) by Shi Pei Pu, a male Peking opera singer who performed female roles, whom Boursicot claimed h...

 

Pithos found in Knossos, Crete, about 1500 BC. A pithos (several pithoi) is a large jar used for storage. It was common in the whole Mediterranean. It was used for storing things like wine, vegetable oil or grain. Pithoi were common in the Aegean and on Crete. These jars were very big, they could reach the height of a man. As a consequence, creating them required special skill. Pithoi were similar to amphoras, but they were usually bigger, and had a flat bottom. Pithoi were sometimes used for...

 

Car company This article contains text that is written in a promotional tone. Please help improve it by removing promotional language and inappropriate external links, and by adding encyclopedic text written from a neutral point of view. (May 2023) (Learn how and when to remove this message) This article needs additional citations for verification. Please help improve this article by adding citations to reliable sources. Unsourced material may be challenged and removed.Find sources: HiPh...

Tractatus politicus est dissertatio a Benedicto de Spinoza anno 1675 scripta, anno 1677 post mortem auctoris edita, in qua pax sub ius naturale et maiestas optima monarchiae vel oligarchiae, ac democratiae definiuntur. Cum verbo est In quo demonstratur quomodo Societas, ubi Imperrium Mararchicum sucut et ea, ubi Optimi imperiat, debet institui, ne in Tyrannidem labatur, et ut Pax, Libertasque civium inviolata maneat. Pax enim non belli privatio, sed virtus est, quae ex animi fortitudine oritu...

 

Traject van de spoorweg (zwarte lijn) Aankomst van de eerste locomotief in Léopoldville (1898) De Compagnie du Congo pour le Commerce et l'Industrie (kortweg Compagnie du Congo of CCCI) was de eerste grote onderneming in de Onafhankelijke Congostaat. Geschiedenis De Compagnie du Congo werd opgericht door Albert Thys in 1886 om een spoorlijn te bouwen tussen Matadi en Stanley Pool. Tussen deze plekken was de Congostroom over een afstand van 350 km onbevaarbaar, vanwege de Livingstonewate...

 

Strategi Solo vs Squad di Free Fire: Cara Menang Mudah!