Аэропорт в летнюю и зимнюю навигацию обслуживает гражданские самолёты авиакомпании Северсталь (Canadair RJ200) и S7 Airlines (Airbus A320), ранее был также местом базирования военной авиации — 227-й отдельной вертолетной эскадрильи (вертолёты Ми-8).
В начале 1994 года аэропорт, расположившийся на бывшем военном аэродроме, был открыт для пассажиров[источник не указан 1903 дня]. До открытия аэропорта функции «второго аэропорта Мурманской области» выполнял аэродром Кировск-Апатиты, расположенный вблизи 9-го километра автодороги Апатиты—Кировск[источник не указан 1903 дня].
В 1996 году ГУАП Хибины перестало выполнять рейсы и позже было признано банкротом. В 1997 году на смену пришло ОАО «Аэропорт»[2].
С 1 апреля 2019 появился новый рейс в Череповец[8].
С 11 февраля 2022 года к выполнению рейсов из С.-Петербурга в «Хибины» приступила авиакомпания «Россия»[9], а с 26 декабря – из Москвы (Шереметьево) в Апатиты начал летать «Аэрофлот».[10]
