Из дворянского рода, восходящего к 1-й половине XVI в. Сын помещика Чебоксарского уезда Казанской губ. Сергея Александровича Кушникова от брака с Екатериной Михайловной Карамзиной, старшей сестрой историка.
Образование получил в Сухопутном Шляхетском кадетском корпусе в Санкт-Петербурге, по окончании которого в 1787 выпущен поручиком в армейский полк.
Участник русско-турецкой войны 1787—91. За отличие при штурме Очакова (декабрь 1789) награждён золотым крестом; тогда же познакомился с генерал-аншефом гр. А. В. Суворовым.
В 1799—1800 гг., в чине полковника, состоял старшим адъютантом при генерал-фельдмаршале гр. А. В. Суворове, участвовал во многих сражениях. Известный своей отвагой, он не раз, как вспоминали современники, под огнём неприятеля доставлял приказы главнокомандующего в самую гущу боя.
А. В. Суворов писал посланнику в Баварии барону К. Я. Бюлеру:
Мой настоящий старший адъютант — полковник Кушников, известный Вам лично. Ему поручались все важные дела, причем он исполнял их с неизменным усердием и неутомимостью, чем и заслужил от меня полное одобрение. Вот почему я от всего сердца пожелал бы ему отличия….
С 1800 г. командовал Гренадерским генерала Розенберга полком. В 1801 г., после воцарения императора Александра I, по болезни перешел на гражданскую службу: состоял прокурором Берг-коллегии, затем Московским вице-губернатором. В 1802—04 петербургский губернатор. Во время войн с Францией 1805, 1806—1807 состоял дежурным генералом при главнокомандующем 6-й областью ополчения.
В ноябре 1807 года получил чин тайного советника и с 7 ноября был назначен сенатором. В период с февраля 1808 по 25.02.1810 года председательствовал в диванах Молдавии и Валахии в Яссах. После 25.02.1810 года, поселившись в Москве, присутствовал в московских департаментах Сената.
В 1823 назначен почетным опекуном Московского опекунского совета, управляющим Инвалидным домом и Павловской больницей, а с июня того же года состоял также первенствующим членом Комиссии для строения в Москве храма Христа Спасителя.
Из многочисленных членов верховного уголовного суда только четверо говорили против смертной казни: адмирал Мордвинов, ген.-от-инфантерии граф Толстой, ген.-лейт. Эммануэль и сенатор Кушников.
— Долгоруков П. В. Князь Сергей Григорьевич Волконский (Некролог)
В 1827 назначен членом Государственного совета и почетным опекуном Петербургского опекунского совета. С 1832 до конца жизни состоял председателем Комиссии прошений. Удостоен всех высших российских орденов, до ордена Св. Апостола Андрея Первозванного включительно (1837). Скончался в Санкт-Петербурге на 74-м году жизни; похоронен на Тихвинском кладбище Александро-Невской лавры.
По свидетельству М. А. Дмитриева, «он был красавец собою, ума основательного, человек просвещенный и добрый… Он… говорил прекрасно по-французски… знал языки: немецкий и италианский; был любимым адъютантом Суворова… и имел много иностранных орденов, которые до войны 12-го года были большою редкостию. Он сам любил Суворова, вспоминал об нем всегда с чувством…».
Жена — Екатерина Петровна Бекетова (1772—26.09.1827[5]), одна из наследниц купца-миллионера И. С. Мясникова, дочь полковника Петра Афанасьевича Бекетова (1732—1796), женатого вторым браком на Ирине Ивановне Мясниковой (1741—1825). Москвичка по рождению, Екатерина Петровна большую часть жизни прожила в Москве; её братья — действительный тайный советникПётр Петрович и известный библиофил и собиратель русских портретов Платон Петрович Бекетовы. Умерла от чахотки, похоронена на кладбище Новоспасского монастыря. В браке имела детей:
Пётр Сергеевич(1799—1801)
Елизавета Сергеевна (1800—1828), фрейлина, с 27 сентября 1825 года жена генерал-лейтенанта Н. М. Сипягина.
↑ 12Придворный месяцеслов на лето от Рождества Христова 1805
↑Придворный месяцеслов на лето от Рождества Христова 1802
↑ 12Придворный месяцеслов на лето от Рождества Христова 1827. Часть I.
↑Знаки не указаны в списках кавалерам орденов за 1830-е гг., но значатся в справочнике В. П. Пономарёва и В. М. Шабанова (стр. 195) и справочнике Д. Н. Шилова «Государственные деятели Российской империи. 1802—1917. Биобиблиографический справочник» (Спб., 2002, с. 402)