Округ Джефферсон был сформирован в 1836 году. Он был назван в честь Томаса Джефферсона, третьего президента США.
География
По данным бюро переписи населения США площадь округа Джефферсон составляет 2878 км², из которых 2340 км² — суша, а 538 км² — водная поверхность (18.69 %).