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Esta é uma lista taxônomica do domínio Archaea.

Archaea é um domínio de seres procariotas, quimiotróficos e extremófilos. A seguinte lista mostra a taxonomia do grupo até o nível de gênero, baseado nas classificações de Garrity e colaboradores (2007) ^[1] e Euzéby (2009) ^[2].

Taxonomia

Domínio Archaea Woese, Kandler & Wheelis 1990
- Filo I. Crenarchaeota Garrity & Holt 2001
  - Classe I. Thermoprotei Reysenbach 2002
    - Ordem I. Thermoproteales Zillig & Stetter 1982
      - Família I. Thermoproteaceae Zillig & Stetter 1982
        Gênero I. Thermoproteus Zillig & Stetter 1982
        
        Gênero II. Caldivirga Itoh, Suzuki, Sanchez & Nakase 1999
        
        Gênero III. Pyrobaculum Huber, Kristjansson & Stetter 1988
        
        Gênero IV. Thermocladium Itoh, Suzuki & Nakase 1998
        
        Gênero V. Vulcanisaeta Itoh, Suzuki & Nakase 2002
      - Família II. Thermofilaceae Burggraf, Huber & Stetter 1997
        Gênero I. Thermofilum Zillig & Gierl 1983
    - Ordem II. Acidilobales Prokofeva, Kostrikina, Kolganova, Tourova, Lysenko, Lebedinsky & Bonch-Osmolovskaya 2009
      - Família I. Acidilobaceae Prokofeva, Kostrikina, Kolganova, Tourova, Lysenko, Lebedinsky & Bonch-Osmolovskaya 2009
        Gênero I. Acidilobus Prokofeva, Miroshnichenko, Kostrikina, Chernyh, Kuznetsov, Tourova & Bonch-Osmolovskaya 2000
      - Família II. Caldisphaeraceae Prokofeva, Kostrikina, Kolganova, Tourova, Lysenko, Lebedinsky & Bonch-Osmolovskaya 2009
        Gênero I. Caldisphaera Itoh, Suzuki, Sanchez & Nakase 2003
    - Ordem III. Desulfurococcales Huber & Stetter 2002
      - Família I. Desulfurococcaceae Zillig & Stetter 1983
        Gênero I. Desulfurococcus Zillig & Stetter 1983
        
        Gênero II. Aeropyrum Sako, Nomura, Uchida, Ishida, Morii, Koga, Hoaki & Maruyama 1996
        
        Gênero III. Ignicoccus Huber, Burggraf, Mayer, Wyschkony, Rachel & Stetter 2000
        
        Gênero IV. Ignisphaera Niederberger, Götz, MacDonald, Ronimus & Morgan 2006
        
        Gênero V. Staphylothermus Stetter & Fiala 1986
        
        Gênero VI. Stetteria Jochimsen, Peinemann-Simon, Völker, Stüben, Botz, Stoffers, Dando & Thomm 1998
        
        Gênero VII. Sulfophobococcus Hensel, Matussek, Michalke, Tacke, Tindall, Kohlhoff, Siebers & Dielenschneider 1997
        
        Gênero VIII. Thermodicus Stetter 2003
        
        Gênero IX. Thermosphaera Huber, Dyba, Huber, Burggraf & Rachel 1998
      - Família II. Pyrodictiaceae Burggraf, Huber & Stetter 1997
        Gênero I. Pyrodictium Stetter, König & Stackebrandt 1984
        
        Gênero II. Hyperthermus Zillig, Holz & Wunderl 1991
        
        Gênero III. Pyrolobus Blöch, Rachel, Burggraf, Hafenbradl, Jannasch & Stetter 1999
    - Ordem IV. Sulfolobales Stetter 1989
      - Família I. Sulfolobaceae Stetter 1989
        Gênero I. Sulfolobus Brock, Brock, Belly & Weiss 1972
        
        Gênero II. Acidianus Segerer, Neuner, Kristjansson & Stetter 1986
        
        Gênero III. Metallosphaera Huber, Spinnler, Gambacorta & Stetter 1989
        
        Gênero IV. Stygiolobus Segerer, Trincone, Gahrtz & Stetter 1991
        
        Gênero V. Sulfurisphaera Kurosawa, Itoh, Iwai, Sugai, Uda, Kimura, Horiuchi & Itoh 1998
        
        Gênero VI. Sulfurococcus Golovacheva, Val'Ekho-Roman & Troitskii 1985
- Filo II. Euryarchaeota Garrity e Holt 2001
  - Classe I. Methanobacteria Boone 2002
    - Ordem I. Methanobacteriales Balch & Wolfe 1981
      - Família I. Methanobacteriaceae Barker 1956
        Gênero I. Methanobacterium Kluyver & van Niel, 1936
        
        Gênero II. Methanobrevibacter Balch & Wolfe 1981
        
        Gênero III. Methanosphaera Miller & Wolin 1985
        
        Gênero IV. Methanothermobacter Wasserfallen, Nölling, Pfister, Reeve & Conway de Macario 2000
        
        Família II. Methanothermaceae Stetter 1982
        
        Gênero I. Methanothermus Stetter 1982
  - Classe II. Methanococci Boone 2002
    - Ordem I. Methanococcales Balch & Wolfe 1981
      - Família I. Methanococcaceae Balch & Wolfe 1981
        Gênero I. Methanococcus Kluyver & van Niel 1936
        
        Gênero II. Methanothermococcus Whitman 2002
      - Família II. Methanocaldococcaceae Whitman, Boone & Koga 2002
        Gênero I. Methanocaldococcus Whitman 2002
        
        Gênero II. Methanotorris Whitman 2002
  - Classe III. Methanomicrobia Garrity, Bell & Lilburn 2003
    - Ordem I. Methanocellales Sakai, Imachi, Hanada, Ohashi, Harada & Kamagata 2008
      - Família I. Methanocellaceae Sakai, Imachi, Hanada, Ohashi, Harada & Kamagata 2008
        Gênero I. Methanocella Sakai, Imachi, Hanada, Ohashi, Harada & Kamagata 2008
    - Ordem II. Methanomicrobiales Balch & Wolfe 1981
      - Família I. Methanomicrobiaceae Balch & Wolfe 1981
        Gênero I. Methanomicrobium Balch & Wolfe 1981
        
        Gênero II. Methanoculleus Maestrojuán, Boone, Xun, Mah & Zhang 1990
        
        Gênero III. Methanofollis Zellner, Boone, Keswani, Whitman, Woese, Hagelstein, Tindall & Stackebrandt 1999
        
        Gênero IV. Methanogenium Romesser, Wolfe, Mayer, Spiess & Walther-Mauruschat 1981
        
        Gênero V. Methanolacinia Zellner, Messner, Kneifel, Tindall, Winter & Stackebrandt 1900
        
        Gênero VI. Methanoplanus Wildgruber, Thomm, König, Ober, Ricchiuto & Stetter 1984
        
        Gênero VII. Methanosphaerula Cadillo-Queiroz, Yavitt & Zinder 2009
      - Família II. Methanocorpusculaceae Zellner, Stackebrandt, Messner, Tindall, Conway de Macario, Kneifel, Sleyter & Winter 1989
        Gênero I. Methanocorpusculum Zellner, Alten, Stackebrandt, Conway de Macario & Winter 1988
      - Família III. Methanospirillaceae Boone, Whitman & Koga 2002
        Gênero I. Methanospirillum Ferry, Smith & Wolfe 1974
      - Família Incertae sedis
        Gênero I. Methanocalculus Ollivier, Fardeau, Cayol, Magot, Patel, Prensier & Garcia 1998
        
        Gênero II. Methanolinea Imachi, Sakai, Sekiguchi, Hanada, Kamagata, Ohashi & Harada 2008
    - Ordem III. Methanosarcinales Boone, Whitman & Koga 2002
      - Família I. Methanosarcinaceae Balch & Wolfe 1981
        Gênero I. Methanosarcina Kluyver & van Niel 1936
        
        Gênero II. Methanimicrococcus Sprenger, van Belzen, Rosenberg, Hackstein e Keltjens 2000
        
        Gênero III. Methanococcoides Sowers & Ferry 1985
        
        Gênero IV. Methanohalobium Zhilina & Zavarzin 1988
        
        Gênero V. Methanohalophilus Paterek & Smith 1988
        
        Gênero VI. Methanolobus König & Stetter 1983
        
        Gênero VII. Methanomethylovorans Lomans, Maas, Luderer, Op Den Camp, Pol, van der Drft & Vogels 2004
        
        Gênero VIII. Methanosalsum Boone & Baker 2002
        Haloquadratum walsbyi
      - Família II. Methanosaetaceae Boone, Whitman & Koga 2002
        Gênero I. Methanosaeta Patel & Sprott 1990
        
        Gênero II. Methanothrix Huser, Wuhrmann & Zehnder 1984
      - Família III. Methermicoccaceae Cheng, Qiu, Yin, Wu, Hu, Deng & Zhang 2007
        Gênero I. Methermicoccus Cheng, Qiu, Yin, Wu, Hu, Deng & Zhang 2007
  - Classe IV. Halobacteria Grant, Kamekura, McGenity & Ventosa 2002
    - Ordem I. Halobacteriales Grant & Larsen 1989
      - Família I. Halobacteriaceae Gibbons 1974
        Gênero I. Halobacterium Elazari-Volcani 1957
        
        Gênero II. Haladaptatus Savage, Krumholz, Oren & Elshahed 2007
        
        Gênero III. Halalkalicoccus Xue, Fan, Ventosa, Grant, Jones, Cowan & Ma 2005
        
        Gênero IV. Haloarcula Torreblanca, Rodriguez-Valera, Juez, Ventosa, Kamekura & Kates 1986
        
        Gênero V. Halobaculum Oren, Gurevich, Gemmell & Teske 1995
        
        Gênero VI. Halobiforma Hezayen, Tindall, Steinbüchel & Rehm 2002
        
        Gênero VII. Halococcus Schoop 1935
        
        Gênero VIII. Haloferax Torreblanca, Rodriguez-Valera, Juez, Ventosa, Kamekura & Kates 1986
        
        Gênero IX. Halogeometricum Montalvo-Rodriguez, Vreeland, Oren, Kessel, Betancourt & López-Garriga 1998
        
        Gênero X. Halomicrobium Oren, Elevi, Watanabe, Ihara & Corcelli 2002
        
        Gênero XI. Halopiger Gutiérrez, Castillo, Kamekura, Xue, Ma, Cowan, Jones, Grant & Ventosa 2007
        
        Gênero XII. Haloplanus Elevi Bardavid, Mana & Oren 2007
        
        Gênero XIII. Haloquadradum Burns, Janssen, Itoh, Kamekura, Li, Jensen, Rodríguez-Valera, Bolhuis & Dyall-Smith 2007
        
        Gênero XIV. Halorhabdus Waino, Tindall & Ingvorsen 2000
        
        Gênero XV. Halorubrum McGenity & Grant 1996
        
        Gênero XVI. Halosarcina Savage, Krumholz, Oren & Elshahed 2008
        
        Gênero XVII. Halosimplex Vreeland, Straight, Krammes, Dougherty, Rosenberg & Kamekura 2003
        
        Gênero XVIII. Halostagnicola Castillo, Gutiérrez, Kamekura, Xue, Ma, Cowan, Jones, Grant & Ventosa 2006
        
        Gênero XIX. Haloterrigena Ventosa, Gutiérrez, Kamekura & Dyall-Smith 1999
        
        Gênero XX. Halovivax Castillo, Gutiérrez, Ma, Cowan, Jones, Grant & Ventosa 2006
        
        Gênero XXI. Natrialba Kamekura & Dyall-Smith 1996
        
        Gênero XXII. Natrinema McGenity, Gemmell & Grant 1998
        
        Gênero XXIII. Natronobacterium Tindall, Ross & Grant 1984
        
        Gênero XXIV. Natronococcus Tindall, Ross & Grant 1984
        
        Gênero XXV. Natronolimnobius Itoh, Yamaguchi, Zhou & Takashina 2005
        
        Gênero XXVI. Natronomonas Kamekura, Dyall-Smith, Upasani, Ventosa & Kates 1997
        
        Gênero XXVII. Natronorubrum Xu, Zhou & Tian 1999
  - Classe V. Thermoplasmata Reysenbach 2002
    - Ordem I. Thermoplasmatales Reysenbach 2002
      - Família I. Thermoplasmataceae Reysenbach 2002
        Gênero I. Thermoplasma Darland, Brock, Samsonoff & Conti 1970
      - Família II. Picrophilaceae Schleper, Pühler, Klenk & Zillig 1996
        Gênero I. Picrophilus Schleper, Pühler, Klenk & Zillig 1996
      - Família III. Ferroplasmataceae Golyshina, Pivovarova, Karaviako, Kondrateva, Moore, Abraham, Lünsdorf, Timmis, Yakimov & Golyshin 2000
        Gênero I. Ferroplasma Golyshina, Pivovarova, Karaviako, Kondrateva, Moore, Abraham, Lünsdorf, Timmis, Yakimov & Golyshin 2000
        
        Gênero II. Acidiplasma Golyshina, Yakimov, Lünsdorf, Ferrer, Nimitz, Timmis, Wray, Tindall & Golyshin 2009
      - Família Incertae sedis
        Gênero I. Thermogymnomonas Itoh, Yoshikawa & Takashina 2007
  - Classe VI. Thermococci Zillig & Reysenbach 2002
    - Ordem I. Thermococcales Zillig, Holtz, Klenk, Trent, Wurdel, Janekovic, Imsel & Haas 1988
      - Família I. Thermococcaceae Zillig, Holtz, Klenk, Trent, Wurdel, Janekovic, Imsel & Haas 1988
        Gênero I. Thermococcus Zillig 1983
        
        Gênero II. Palaeococcus Takai, Sugai, Itoh & Horikoshi 2000
        
        Gênero III. Pyrococcus Fiala & Stetter 1986
  - Classe VII. Archaeoglobi Garrity & Holt 2002
    - Ordem I. Archaeoglobales Huber & Stetter 2002
      - Família I. Archaeoglobaceae Huber & Stetter 2001
        Gênero I. Archaeoglobus Stetter 1988
        
        Gênero II. Ferroglobus Hafenbradl, Keller, Dirmeier, Rachel, Robnagel, Burggraf, Huber & Stetter 1996
        
        Gênero III. Geoglobus Kashefi, Tor, Holmes, Gaw van Praagh, Reysenbach & Lovley 2002
  - Classe VIII. Methanopyri Garrity & Holt 2002
    - Ordem I. Methanopyrales Huber & Stetter 2002
      - Família I. Methanopyraceae Huber & Stetter, 2002
        Gênero I. Methanopyrus Kurr, Huber, König, Jannasch, Fricke, Trincone, Kristjansson & Stetter 1991

Observações

Dois outros possíveis filos são descritos na literatura, Korarchaeota e Nanoarchaeota, entretanto suas validades são questionadas, não constando na última edição do Bergey's Manual of Systematic Biology (2004/05). Em 2008, um novo filo foi proposto, o Thaumarchaeota, para abrigar arquéias mesófilas.

Korarchaeota Barns, Delwiche, Palmer & Pace 1996

Conhecida somente de seqüências genéticas de ARNr 16S obtida de amostras de fontes hidrotermais de alta temperatura do Parque Yellowstone. Análise do material sugere que não pertence aos outros grupos principais de arquéias, Crenarchaeota e Euryarchaeota, sendo de origem mais antiga. Entretanto, é possível que o Korarchaeota não seja um grupo separado, mas simplesmente um organismo que tenha sofrido uma mutação rápida ou não usual do gene ARNr 16S. ^[3] ^[4]

Nanoarchaeota Huber, Hohn, Rachel, Fuchs, Wimmer & Stetter 2002

Filo criado em 2002 para abrigar a espécie hipertermófila Nanoarchaeum equitans cujas relações de parentesco são incertas. Ao comparar a seqüência ARNr com as dos outros dois filos, são encontradas diferenças tão grandes quantos a diferença entre ambos os filos. Outros pesquisadores, no entanto, sugerem que esta arquéia seja relacionada as Thermococcales, do filo Euryarchaeota. ^[5] ^[6] ^[7]

Thaumarchaeota Brochier-Armanet, Boussau, Gribaldo & Forterre 2008

O filo foi proposto baseado em dados filogenéticos, como seqüência de RNA ribossômico, e a presença de uma forma de topoisomerase tipo I, que previamente era encontrada apenas em eucariontes, para abrigar arquéias mesofílicas, que até então eram agrupadas no filo Crenarchaeota. ^[8] ^[9]

Referências

↑ GARRITY, G. M.; LILBURN, T. G.; COLE, J. R., HARRISON, S. H.; EUZÉBY, J.; TINDALL, B. J. Archaea In Taxonomic Outline of the Bacteria and Archaeae (TOBA) Arquivado em 1 de dezembro de 2008, no Wayback Machine.. Versão 7.7 de 6 de março de 2007. Acessado em 20 de novembro de 2008.
↑ EUZÉBY, J. P. Classification of domains and phyla - Hierarchical classification of prokaryotes (bacteria) Arquivado em 27 de janeiro de 2013, no Wayback Machine.. In List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN) Arquivado em 16 de maio de 2011, no Wayback Machine.. Acessado em 12 de dezembro de 2009.
↑ AUCHTUNG, T. A.; TAKACS-VESBACH, C. D.; CAVANAUGH, C. M. (2006). 16S rRNA Phylogenetic Investigation of the Candidate Division “Korarchaeota”. Appl. Environ. Microbiol. 72 (7): 5077–5082. Abstract
↑ BARNS, S. M.; DELWICHE, C. F.; PALMER, J. D.; PACE, N. R. (1996). Perspectives on archaeal diversity, thermophily and monophyly from environmental rRNA sequences. PNAS 93 (17): 9188-9193. Abstract
↑ HUBER, H.; HOHN, M. J.; RACHEL, R.; FUCHS, T.; WIMMER, V.C.; STETTER, K. O. (2002). A new phylum of Archaea represented by a nanosized hyperthermophilic symbiont. Nature 417 (6884): 27 – 8. Abstract
↑ WATERS, E. et al. (2003). The genome of Nanoarchaeum equitans: insights into early archaeal evolution and derived parasitism. Proceedings of the National Academy of Sciences 100 (22): 12984-8. Abstract
↑ BROCHIER, C.; GRIBALDO, S.; ZIVANOVIC, Y.; CONFALONIERI, F.; FORTERRE, P. (2005). Nanoarchaea: representatives of a novel archaeal phylum or a fast-evolving euryarchaeal lineage related to Thermococcales?. Genome Biology 6 (5): R42. Abstract
↑ BROCHIER-ARMANET, C.; BOUSSAU, B.; GRIBALDO, S.; FORTERRE, P. (2008). Mesophilic Crenarchaeota: proposal for a third archaeal phylum, the Thaumarchaeota. Nature Review Microbiology 6 (3): 245-253. Abstract
↑ BROCHIER-ARMANET, C.; GRIBALDO, S.; FORTERRE, P. (2008). A DNA topoisomerase IB in Thaumarchaeota testifies for the presence of this enzyme in the last common ancestor of Archaea and Eucarya. Biology Direct 3: 54. Completo Abstract

Bibliografia adicional

GARRETT, R. A.; KLENK, R.-P. Archaea: Evolution, Physiology and Molecular Biology. Malden (Maryland): Blackwell Publishing, 2007. 288 p.
GARRITY, G. M. (ed.). Bergey's Manual of Systematic Bacteriology volume 2: parts A, B and C. 2ª ed. Nova Iorque: Springer-Verlag, 2005.
GARRITY, G. M.; BELL, J. A.; LILBURN, T. G. Taxonomic Outline of the Prokaryotes Bergey's Manual of Systematic Bacteriology. 2ª ed. versão 5.0 de maio de 2004. Nova Iorque: Springer-Verlag, 2004.
GARRITY, G. M. (ed.). Bergey's Manual of Systematic Bacteriology Volume 1: The Archaea and the Deeply Branching and Phototrophic Bacteria. 2ª ed. Nova Iorque: Springer-Verlag, 2002.