Pierwsza wzmianka o wsi jest stosunkowo późna, bo pochodzi z 1411 Jednakże z badań archeologicznych wynika, że pierwotny dwór w pobliżu dzisiejszej siedziby powstał ok. 1300. Była to siedziba obronna i spalona została zapewne przez Krzyżaków w 1331 Następny dwór poowstał ok. 1400 i przetrwał do ok. XVI w. Dawna siedziba rodu Poraitów, którzy przybrali nazwisko Kościerskich.
W czasie II wojny światowej Kościerzyn został włączony w granice Kraju Warty. Z miejscowości tej Niemcy dokonywali masowych wysiedleń ludności polskiej i osiedlali niemieckich przesiedleńców ze wschodniej Europy i krajów bałtyckich.
Zabytki
Obecny dwór został wzniesiony w latach 1914–1915/1916 dla syna Wincentego Prądzyńskiego – Stanisława. Jest to budowla murowana, parterowa, kryta wysokim łamanym dachem. Dwór mimo późnej metryki w pełni nawiązuje do tradycyjnego tzw. stylu dworkowego. Otacza go park o pow. 5 ha, w którym jest staw z wyspą oraz pomnikowe okazy drzew: jesion, klon, wiąz i modrzew. Zespół dworsko-parkowy pozostaje w użytkowaniu Ośrodka Doradztwa Rolniczego.