Następnie został wikariuszem parafii w Nawiadach, w latach 1962–1970 pracował na parafii w Giżycku, a później w latach 1970–1975 jako wikariusz diecezjalny w Bielsku-Białej, gdzie w 1975 został wybrany na drugiego proboszcza. W 1979 powierzono mu funkcję Konsenioradiecezji cieszyńskiej, a w grudniu 1980 został wybrany Seniorem Diecezji. Na tym stanowisku powołał do życia pierwszą księgarnię ewangelicką „Logos” w Cieszynie oraz przyczynił się do budowy Ośrodka Wydawniczego „Augustana” (1992)[2]. 6 stycznia 1991 Synod Kościoła wybrał go Biskupem Kościoła. 3 maja 1991 w Warszawie został konsekrowany na biskupa Kościoła Ewangelicko-Augsburskiego w Polsce; zastąpił na tym urzędzie ks. bpa Janusza Narzyńskiego.
W 1993 został wybrany na prezesa Polskiej Rady Ekumenicznej na pięcioletnią kadencję. W 1996 wybrano go ponownie na to stanowisko. Trzykrotnie spotykał się z przebywającym w Polsce papieżem Janem Pawłem II w Warszawie (1991), we Wrocławiu (1997) i w Drohiczynie (1999).
Syn Andrzeja. Żoną Jana Szarka była Aniela Szarek (ur. 18 marca1936, zm. 5 stycznia2019), z wykształcenia ekonomistka, pracująca jako naczelniczka wydziału Narodowego Banku Polskiego. Aniela Szarek była również autorką artykułów na łamach Zwiastuna Ewangelickiego i Kalendarza Ewangelickiego. Dziećmi Jana i Anieli Szarek są ks. Piotr Szarek i córka Ewa[8].
↑Anna MonikaA.M.ChyłaAnna MonikaA.M., Szkolnictwo ewangelickie i ewangelikalne w Polsce po 1989 roku, Wrocław: Instytut Pedagogiki Uniwersytetu Wrocławskiego, 2019, s. 143, ISBN 978-83-62618-50-7, OCLC1151278111 [dostęp 2021-10-30].
.jpg)
