Przez Gdańsk Olszynkę przechodzi linia kolejowa nr 226, łącząca Pruszcz Gdański z Portem Północnym w Gdańsku. Linia jest linią typowo towarową, dwutorową, zelektryfikowaną, normalnotorową[2]. Odgałęzia się tu także zelektryfikowana bocznica Lotos Kolej, rozpoczynająca się ukresem rozjazdu nr 36 w torze stacyjnym nr 7. Prędkość na łącznicy wynosi 40 km/h[3]. Przez stacje przejeżdżają pociągi towarowe, zarówno PKP Cargo jak i prywatnych przewoźników.
Infrastruktura
Semafory na stacji Gdańsk Olszynka
Na stacji ruch sterowany jest za pomocą semaforów świetlnych. Na stacji znajduje się nastawnia oraz kładka dla pieszych.