Pirey Tira sens dobte lo sieu nom de lo sieu sòl pierreux.
Lo sieu orthographe a evolucionat al cors del temps : Piré, Pyrei (1143), Pirey (1178), Pièger (1244), Pyre (1285), Pirei (1316), Pyrey (1323), de Pireyo (1394).
La primièra mencion importanta de Pirey data de 1334, en un acte de parteja entre Poncart, Guillaume e Jacques de Thoraise. En 1477, presoèr dels òmes del rei de França, Hugues de Chalon-Chatelguyon, senhor de Pirey, #vendre aquela tèrra a Pèira Despotots per pagar la siá rançon.
Divèrses senhors se #partejar aquel territòri al cors dels sègles seguents : las familhas Despotots, Perrenot, Achey, Gorrevod, Thomassin, Arnoulx de Pirey, aital coma lo capítol metropolitan de Besançon e l'espital del Sant-Esperit.
En 1674, Pirey #sentir los efièches désastreux del banc de Besançon per las tropas de Louis XIV. En 1805, la municipalitat recebuda una importanta part del mobilier del Coatz Minimas de Consolation. En 1814, lo vilatge #èsser a nòu estrossejat per las tropas d'aucupacion.
Pirey tire sans doute son nom de son sol pierreux.
Son orthographe a évolué au cours du temps : Piré, Pyrei (1143), Pirey (1178), Pire (1244), Pyre (1285), Pirei (1316), Pyrey (1323), de Pireyo (1394).
La première mention importante de Pirey date de 1334, dans un acte de partage entre Poncart, Guillaume et Jacques de Thoraise. En 1477, prisonnier des hommes du roi de France, Hugues de Chalon-Chatelguyon, seigneur de Pirey, vendit cette terre à Pierre Despotots pour payer sa rançon.
Divers seigneurs se partagèrent ce territoire au cours des siècles suivants : les familles Despotots, Perrenot, Achey, Gorrevod, Thomassin, Arnoulx de Pirey, ainsi que le chapitre métropolitain de Besançon et l'hôpital du Saint-Esprit.
En 1674, Pirey ressentit les effets désastreux du siège de Besançon par les troupes de Louis XIV. En 1805, la commune acquit une importante partie du mobilier du Couvent des Minimes de Consolation. En 1814, le village fut à nouveau ravagé par les troupes d'occupation.