Det var ingen gjestedommere, kun i finalen og auditions, ellers var det var tre permanente dommere
Det ble holdt en egen episode kalt «Møt Topp 20», der alle danserne danset i sine egne stiler. Dagen etter ble det holdt en konkurransesending med pardanser, soloer og eliminering. Dette måtte de gjøre for topp 18-episoden og, grunnet «the World Series». Fra topp 16-episodene er det både fremførelses- og resultatsending
I finalen denne sesongen har vi 6 dansere i finalen, og ikke 4, som programmet vanligvis har. Dette er mest sannsynlig grunnet at de ikke vil sende So You Think You Can Dance i juleferien.
Audition
Som siden i 2006, er nedre aldersgrense 18 år, og 30 år er øverste. Deltagere som er over 30, kan få en opptreden på programmet uansett, men personen kan ikke komme videre. De som gikk videre fra audition gikk til Vegas-uken, der dommerne valgte topp 20. Auditionrunden for sesong 6 ble holdt i disse byene:
1 Finalisten Billy Bell ble alvorlig syk den 27. oktober2009, så han kunne ikke opptre. Dermed takket hiphopdanseren Brandon Dumlao ja til å overta plassen og lære seg alt på en dag. Dumlao røk ut første uken, pga. den korte tiden i konkurransen. Både Dumlao og Bell fikk lov til å prøve igjen for sesong 7, der Billy Bell kom blant de 5 beste.
