Jens Holmboe var sønn av Hans Jenssen Holmboe (1721–1756) og Birgitte Marie Reinholtsdatter Ziegler (1723–1778), som var datter av Reinhold Ziegler (1677–1729) som eide jernverket i Lesjaverk (etablert 1659). Hans Jenssen Holmboe hadde i 1750 kjøpt jernverket av svigerfarens etterkommere, men døde i 1756 da Jens var kun fire år. Så mora giftet seg med Paul Holst Irgens (1724–1784) som var sjef ved Folldals kopperverk.
I 1783 giftet han seg med Anna Margrethe Irgens (1766–1851) fra Tromsø, datter av presten Johannes Irgens (1723–1782) som var storebroren til stefaren Paul.
Målselvdalen: Jens Holmboe fikk tilflyttere fra Østerdalen til å flytte til Målselvdalen og etablere jordbruk der. Sammen med skoginspektør Nicolai Hersleb Ramm (1756–1830) fra Røros saumfarte Holmboe dalen i 1789, og med hjelp fra storbonden Ole Olsen Evenstad fra Stor-Elvdal kom flyttingen i gang.[2]
Han sluttet i jobben i 1800 og døde fire år etterpå. Han hadde fra 1785 eid og bebodd gården Ervik i Trondenes. Gården ble bra og han fikk i 1801 en gullmedalje fra Det kgl. danske Landhuusholdningsselskab.