세키가하라역(일본어: 関ヶ原駅 세키가하라에키[*])은 일본 기후현 후와군 세키가하라정에 있는 도카이 여객철도의 철도역이다. 미나미아라오 신호장에서 갈라진 상행 본선·다루이 지선·하행 본선이, 역 동쪽에서 합쳐진다. 이름에서 볼 수 있듯 역 주변에는 세키가하라 전투가 일어났던 전장지가 있다.
기후 현에 있는 도카이도 본선의 역들 중 가장 서쪽에 있는 역으로, 세키가하라 역 서쪽에는 기후 현과 시가현의 경계가 있다. 세키가하라 역에 종착하는 열차들도 존재하며, 마이바라 역 ~ 세키가하라 역 구간은 시간당 2편 꼴로 열차가 비교적 적게 운행된다.
쌍섬식 2면 4선 구조의 지상역이다. 역사는 승강장 남쪽에 있으며, 승강장과는 구름다리로 이어져 있다.
오가키역이 관리하는 업무 위탁역으로, 영업은 도카이 교통 사업이 대신 하고 있다. TOICA 및 제휴 교통카드의 사용이 가능하다.