Massone, Eckartshausen si unì successivamente all'ordine degli Illuminati fondato da Adam Weishaupt, con il nome d'ordine di Aetilius Regulus, ma «ritirò la sua appartenenza subito dopo aver scoperto che quest'ordine riconosceva l'illuminazione solo attraverso la ragione umana».[2]
Von Eckartshausen conosceva Johann Georg Schröpfer, uno dei primi pionieri della fantasmagoria, e lui stesso sperimentò l'uso di lanterne magiche per creare delle "proiezioni fantasma" di fronte ad un pubblico di quattro o cinque persone. Morì a Monaco di Baviera all'età di 50 anni.
Pubblicazioni
Aufschlüsse über Magie.München [Munich], 1790.
Aufschlüsse zur Magie aus geprüften Erfahrungen über verborgene philosophische Wissenschaften und verdeckte Geheimnisse der Natur. 4 vols., Munich. 1788-1792.
Die wichtigsten Hieroglyphen fürs Menschen-Herz. Leipzig, 1796.
Die Wolke über dem Heiligtum.
Gott ist die reinste Liebe. Munich, 1791.
Magic: the principles of higher knowledge. (tradotto in inglese e modificato da Gerhard Hanswille & Deborah Brumlich. -- Scarborough, Ont. : Merkur Pub. Co., c1989.)
^(EN) Theodor Harmsen, Karl von Eckartshausen. Concept of the Inner Church, in "Bibliotheca Philosophica Hermetica", Amsterdam, J.R. Ritman Library, 27 luglio 2005. URL consultato il 17 luglio 2024 (archiviato dall'url originale il 25 maggio 2018).