La EFL League Two 2016-2017, conosciuta anche con il nome di Sky Bet League Two per motivi di sponsorizzazione, è stato il 59º campionato inglese di calcio di quarta divisione, nonché il 13º con la denominazione di League Two.
La stagione regolare ha avuto inizio il 6 agosto 2016 e si è conclusa il 6 maggio 2017, mentre i play off si sono svolti tra il 14 ed il 28 maggio 2017. Ad aggiudicarsi la vittoria è stato il blasonato Portsmouth. Il successo, il primo nella categoria, ha garantito ai Pompey il ritorno dopo cinque anni nella divisione superiore. Le altre tre promozioni in Football League One, sono state invece conseguite dal Plymouth Argyle (2º classificato), dal Doncaster Rovers (3º classificato) e dal Blackpool (vincitore dei play off).
Le prime tre classificate venivano promosse direttamente in Football League One, insieme alla vincente dei play off a cui partecipavano le squadre giunte dal 4º al 7º posto. Mentre le ultime due classificate retrocedevano in National League.