La Druga slovenska nogometna liga 1999-2000 (in lingua italiana: Secondo campionato calcistico sloveno 1999-2000), abbreviata in 2. SNL 1999-2000, fu la nona edizione della seconda serie del campionato di calcio sloveno.[1]
Le 16 squadre partecipanti disputarono un girone all'italiana con gare di andata e ritorno (30 giornate totali) al termine delle quali:
Legenda:
Regolamento:
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