Laureato in Chimica, tra il 2003 e il 2008 è ricercatore presso l'Istituto di Scienze e Tecnologie Molecolari del CNR. Nel 2008 si trasferisce al Dipartimento di Biotecnologie e Bioscienze dell'Università di Milano Bicocca.[2] È sposato e padre di quattro figli.
Nel 2011 è stato nominato vicepresidente della Fraternità di Comunione e Liberazione durante la presidenza di don Julián Carrón.[3] A seguito delle dimissioni di Carròn, in base allo Statuto della Fraternità il prefetto del Dicastero per i Laici, la Famiglia e la Vita, cardinale Kevin Farrell, ha riconosciuto a partire dal 27 novembre 2021 la funzione di presidente della Fraternità a Prosperi.[4] Negli anni successivi, Prosperi ha dato conto delle udienze svolte con Papa Francesco mediante comunicazioni pubbliche.[5]
Opere (parziale)
Prefazione a Luigi Giussani, Una rivoluzione di sé. La vita come comunione (1968-1970), Milano, Rizzoli, 2024, ISBN 978-88-3181-5932.
