Varian Beta SARS-CoV-2

Negara-negara dengan kasus terkonfirmasi varian Beta per 25 Juni 2021[1] Legenda:   1.000+ kasus terkonfirmasi   250–999 kasus terkonfirmasi   100–249 kasus terkonfirmasi   10–99 kasus terkonfirmasi   2–9 kasus terkonfirmasi   1 kasus terkonfirmasi   Tidak ada atau tiada data
Negara-negara dengan kasus terkonfirmasi varian Beta per 25 Juni 2021[1]

Legenda:

  1.000+ kasus terkonfirmasi
  250–999 kasus terkonfirmasi
  100–249 kasus terkonfirmasi
  10–99 kasus terkonfirmasi
  2–9 kasus terkonfirmasi
  1 kasus terkonfirmasi
  Tidak ada atau tiada data

Varian Beta SARS-CoV-2, juga dikenal sebagai garis keturunan B.1.351 atau 501.V2, adalah varian dari SARS-CoV-2, virus yang menyebabkan Covid-19. Varian ini termasuk varian yang dianggap penting. Ia ditemukan pertama kali di Teluk Nelson Mandela,[2] Provinsi Eastern Cape, Afrika Selatan, pada Oktober 2020[3] dan dilaporkan oleh departemen kesehatan negara tersebut pada 18 Desember 2020.[4] Analisis filogeografi menunjukkan bahwa varian ini telah muncul di daerah Teluk Nelson Mandela sejak Juli atau Agustus 2020.[5]

Organisasi Kesehatan Dunia (WHO) melabeli varian ini sebagai varian Beta bukan untuk menggantikan nama ilmiah, melainkan sebagai nama yang dipakai secara umum di ruang publik.[6] WHO menganggapnya sebagai varian yang diwaspadai (variant of concern).[7]

Penemuan

Tim genomik yang dipimpin oleh KwaZulu-Natal Research Innovation and Sequencing Platform (KRISP) di Universitas KwaZulu-Natal menemukan varian baru ini.[8] Varian ini ditemukan dengan pengurutan keseluruhan genom. Urutan genomik garis keturunan ini dikumpulkan ke pangkalan data urutan GISAID.[9]

Sifat

Gejala

Transmisi

Peneliti dan pihak berwenang melaporkan bahwa prevalensi varian ini lebih tinggi di antara orang muda dengan tanpa keadaan kesehatan tertentu dan sering menyebabkan penyakit serius dalam beberapa kasus dibandingkan varian lain.[10][11] Departemen Kesehatan Afrika Selatan juga menyatakan bahwa varian ini mungkin menjadi mendorong gelombang kedua pandemi di negaranya karena varian ini menyebar lebih cepat daripada varian lain sebelumnya.[4][10]

Genetika

Mutasi asam amino varian Beta SARS-CoV-2 yang dipetakan pada peta genom SARS-CoV-2 dengan sorotan pada bagian bulir
Mutasi asam amino varian Beta SARS-CoV-2 yang dipetakan pada peta genom SARS-CoV-2 dengan sorotan pada bagian bulir
Mutasi pada varian Beta
(hanya yang mengubah asam amino)
Gen Nukleotida Asam amino
ORF1ab C1059T T265I
G5230T K1655N
C8660T H2799Y
C8964T S2900L
A10323G K3353R
G13843T D4527Y
C14408T1 P4715L1
C17999T T5912I
Bulir C21614T L18F
A21801C D80A
A22206G D215G
G22299T R246I
G22813T K417N
G23012A E484K
A23063T N501Y
A23403G1 D614G1
G23664T A701V
ORF3a G25563T Q57H
C25904T S171L
E C26456T P71L
N C28887T T205I
Sumber: Tegally dkk. (2021),[5] Extended Data Fig. 5
Catatan:
N501Y berarti perubahan dari asparagina (N) menjadi tirosina (Y) pada posisi asam amino 501.[12]
1Muncul dalam induk garis keturunan B.1.

Mutasi pada SARS-CoV-2 cukup sering: lebih dari empat ribu mutasi telah dideteksi hanya pada bulir proteinnya menurut Konsorsium Britania Raya untuk Genom COVID-19.[13]

Varian ini terdiri dari 31 mutasi: 19 mutasi tak bersinonim, 2 mutasi hapus, dan 10 mutasi bersinonim,[5] yaitu 21 mutasi yang mengubah protein dan 10 mutasi yang tidak berdampak.[14]

Ilmuwan mencatat bahwa varian ini bisa lebih mudah menempel pada sel manusia karena tiga mutasi dalam domain pengikat reseptor (RBD) pada bulir virus, yaitu N501Y,[4][15] K417N, dan E484K.[16][17] Dua di antaranya, E484K dan N501Y, ada dalam motif pengikat reseptor (RBM) dari domain pengikat reseptor (RBD).[5][18] Mutasi N501Y juga ada dalam varian Alpha dan Gamma.

Efikasi vaksin

Perubahan asam amino E484K, sebuah mutasi domain pengikat reseptor (RBD), dilaporkan berhubungan dengan kaburnya dari antibodi penetral yang bisa berdampak buruk terhadap efikasi vaksin Covid-19 yang bergantung pada protein bulir.[19][20] Mutasi bulir E484K dikaitkan dengan kasus reinfeksi dengan varian Beta di Brazil yang diyakini para peneliti sebagai kasus reinfeksi pertama untuk varian ini.[21] Peluang perubahan dalam antigenisitas disebut sebagai "mutasi kabur" dari antibodi monoklonal yang mampu menetralkan protein bulir varian SARS-CoV-2.[22][23]

Statistik

Penyebaran

Pada 23 Desember 2020, Menteri Kesehatan Britania Raya, Matt Hancock, mengumumkan bahwa dua orang yang berkunjung dari Afrika Selatan ke Britania Raya terinfeksi dengan varian Beta (varian 501.V2).[25]

Pada 3 Mei 2021, varian ini telah masuk ke Indonesia.[26] Per 4 Juli 2021, terdapat tujuh kasus di Indonesia yang terkena varian Beta.[27]

Lihat pula

Referensi

  1. ^ Global Report B.1.351 (Laporan) (dalam bahasa Inggris). cov-lineages.org. 25 Juni 2021. Diakses tanggal 25 Juni 2021. 
  2. ^ "SA reaches grim milestone of 1 million Covid-19 cases" (dalam bahasa Inggris). www.iol.co.za. 28 Desember 2020. Diakses tanggal 29 Desember 2020. 
  3. ^ "Covid: South Africa passes one million infections as cases surge". BBC News (dalam bahasa Inggris). 28 Desember 2020. Diakses tanggal 29 Desember 2020. 
  4. ^ a b c "South Africa announces a new coronavirus variant" (dalam bahasa Inggris). The New York Times. 18 Desember 2020. Diakses tanggal 20 December 2020. N501Y...has been found in other countries, including Australia 
  5. ^ a b c d Tegally, Houriiyah; et al. (9 Maret 2021). "Detection of a SARS-CoV-2 variant of concern in South Africa". Nature (dalam bahasa Inggris). 592: 438–443. doi:10.1038/s41586-021-03402-9alt=Dapat diakses gratis. 
  6. ^ "Tracking SARS-CoV-2 variants". www.who.int (dalam bahasa Inggris). Diakses tanggal 30 Juni 2021. 
  7. ^ Kementerian Pendidikan, Kebudayaan, Riset, dan Teknologi Republik Indonesia (15 Juli 2021). "#MerdekaBelajar di Twitter". Twitter. Diakses tanggal 18 Juli 2021. Varian tersebut terbagi atas dua kategori, yakni varian yang diperhatikan (variant of interest [VoI]) dan varian yang diwaspadai (variant of concern [VoC]). 
  8. ^ "South African scientists who discovered new Covid-19 variant share what they know". www.theconversation.com (dalam bahasa Inggris). Diakses tanggal 1 Maret 2021. 
  9. ^ "Risk Assessment: Risk related to spread of new SARS-CoV-2 variants of concern in the EU/EEA". www.ecdc.europa.eu (dalam bahasa Inggris). 29 Desember 2020. Diakses tanggal 23 Januari 2021. This variant was first observed in samples from October, and since then more than 300 cases with the 501.V2 variant have been confirmed by whole genome sequencing (WGS) in South Africa 
  10. ^ a b Wroughton, Lesley; Bearak, Max (18 Desember 2020). "South Africa coronavirus: Second wave fueled by new strain, teen 'rage festivals'". The Washington Post (dalam bahasa Inggris). Diakses tanggal 20 Desember 2020. 
  11. ^ Mkhize, Dr. Zwelini (18 Desember 2020). "Update on Covid-19 (18th December 2020)" (Siaran pers) (dalam bahasa Inggris). South Africa. COVID-19 South African Online Portal. Diakses tanggal 23 Desember 2020. Our clinicians have also warned us that things have changed and that younger, previously healthy people are now becoming very sick. 
  12. ^ Untuk daftar simbol asam amino α yang dipakai dalam protein sesuai arahan RNA duta, lihat ini: "Nomenclature and Symbolism for Amino Acids and Peptides" (dalam bahasa Inggris). IUPAC-IUB Joint Commission on Biochemical Nomenclature. 1983. Diarsipkan dari versi asli tanggal 9 Oktober 2008. Diakses tanggal 5 Maret 2018. 
  13. ^ Wise, Jacqui (16 Desember 2020). "Covid-19: New coronavirus variant is identified in UK". The BMJ (dalam bahasa Inggris). 371: m4857. doi:10.1136/bmj.m4857alt=Dapat diakses gratis. ISSN 1756-1833. 
  14. ^ Rachmawati, Faidah; Urifah, Nurul; Wijayati, Ari (2009). Biologi untuk SMA/MA Kelas XII Program IPA. Jakarta: Pusat Perbukuan Departemen Pendidikan Nasional. 
  15. ^ Abdool Karim, Salim (19 Desember 2020). "The 2nd Covid-19 wave in South Africa: Transmissibility & a 501.V2 variant". Scribd (dalam bahasa Inggris). CAPRISA. hlm. 11. Diakses tanggal 24 Desember 2020. 
  16. ^ Statement of the WHO Working Group on COVID-19 Animal Models (WHO-COM) about the UK and South African SARS-CoV-2 new variants (PDF) (dalam bahasa Inggris), World Health Organization, 22 Desember 2020, diakses tanggal 23 Desember 2020 
  17. ^ Lowe, Derek (22 Desember 2020). "The New Mutations". In The Pipeline (dalam bahasa Inggris). American Association for the Advancement of Science. Diarsipkan dari versi asli tanggal 2021-01-29. Diakses tanggal 23 Desember 2020. I should note here that there’s another strain in South Africa that is bringing on similar concerns. This one has eight mutations in the Spike protein, with three of them (K417N, E484K and N501Y) that may have some functional role. 
  18. ^ "Expert reaction to South African variant of SARS-CoV-2" (dalam bahasa Inggris). Science Media Centre. Diakses tanggal 26 Desember 2020. 
  19. ^ "New virus mutation raises vaccine questions". France 24 (dalam bahasa Inggris). Paris. 13 Januari 2021. Diakses tanggal 13 Januari 2021. 
  20. ^ Callaway, Ewen (7 Januari 2021). "Could new COVID variants undermine vaccines? Labs scramble to find out". Nature (dalam bahasa Inggris). Diakses tanggal 17 Januari 2021. Chief among those is another receptor-binding-domain mutation, called E484K, that de Oliveira’s team has identified in the 501Y.V2 variant. 
  21. ^ "South African coronavirus variant detected in reinfection case in Brazil". Reuters (dalam bahasa Inggris). 8 Januari 2021. Diakses tanggal 11 Januari 2021. 
  22. ^ Weisblum, Yiska; et al. (20 Oktober 2020). "Escape from neutralizing antibodies by SARS-CoV-2 spike protein variants". eLife (dalam bahasa Inggris). 9. doi:10.7554/eLife.61312alt=Dapat diakses gratis. PMC 7723407alt=Dapat diakses gratis. 
  23. ^ "Brief report: New Variant Strain of SARS-CoV-2 Identified in Travelers from Brazil" (PDF) (Siaran pers) (dalam bahasa Inggris). Jepang: NIID (National Institute of Infectious Diseases). 12 Januari 2021. Diakses tanggal 16 Januari 2021. 
  24. ^ Kesalahan pengutipan: Tag <ref> tidak sah; tidak ditemukan teks untuk ref bernama CovLineages1Jul
  25. ^ "Expert reaction to South African variant of SARS-CoV-2, as mentioned by Matt Hancock at the Downing Street press briefing" (dalam bahasa Inggris). Science Media Centre. 23 Desember 2020. Diakses tanggal 24 Desember 2020. The South African variant ‘501.V2’ is characterised by N501Y, E484K and K417N mutations in the S protein – so it shares the N501Y mutation with the UK variant, but the other two mutations are not found in the UK variant. Similarly, the South African variant does not contain the 69-70del mutation that is found in the UK variant. 
  26. ^ Nugraheny, Dian Erika (4 Mei 2021). Prabowo, Dani, ed. "Varian Virus Corona B.1.17, B.1.617, dan B.1.351 Telah Masuk ke Indonesia". Kompas.com. Diakses tanggal 29 Juni 2021. 
  27. ^ Annur, Cindy Mutia (6 Juli 2021). Mutia, Annissa, ed. "463 Sekuens Varian Baru Terdeteksi di Indonesia, Muncul Kappa, Eta, lota". Databoks Katadata. Diakses tanggal 18 Juli 2021. 

Pranala luar

Read other articles:

South Korean TV series or program More Than a MaidPromotional posterAlso known asThe Housemaids The ServantsGenreHistorical Romance ActionCreated byJTBCWritten byJo Hyun-kyungDirected byJo Hyun-takStarringJeong Yu-mi Oh Ji-ho Kim Dong-wookComposerJeon Jung-hyukCountry of originSouth KoreaOriginal languageKoreanNo. of episodes20ProductionExecutive producerPark Jun-seoProducersPark Sang-yeokJo Joon-hyungSong Hyeong-jooProduction companyDrama House (JTBC)Original releaseNetworkjTBCReleaseJa...

 

Gmina TrzcianneNegara PolandiaProvinsiPodlasiePowiatMońkiIbudesaTrzciannePemerintahan • Wali kotaMarek SzydłowskiLuas • Total331,64 km2 (128,05 sq mi)Populasi (2004) • Total4,422 • Kepadatan13/km2 (35/sq mi)Zona waktuUTC+1 (CET) • Musim panas (DST)UTC+2 (CEST)Postal code19-104Car platesBMNSitus webhttp://www.trzcianne.pl/ Powiat Mońki (Gmina Trzcianne) Gmina Trzcianne Gmina Trzcianne (bahasa Polandia:...

 

Municipio de Clifton Municipio Municipio de CliftonUbicación en el condado de Beadle en Dakota del Sur Ubicación de Dakota del Sur en EE. UU.Coordenadas 44°14′23″N 98°09′14″O / 44.2397, -98.1539Entidad Municipio • País  Estados Unidos • Estado  Dakota del Sur • Condado BeadleSuperficie   • Total 92.58 km² • Tierra 92.58 km² • Agua (0 %) 0 km²Altitud   • Media 392 m s. n. m.Población...

الخط 10 لمترو باريس Ligne 10 du métro de Paris معلومات عامة البلد فرنسا  نوع مترو باريس نظام سائق مكان باريس -  فرنسا نقطة البداية بولوني - جسر سان كلود نقطة النهاية غار أوستارليتز عدد المحطات 23 عدد الركاب (يومياً) 43 مليون مسافر في السنة (2009) التشغيل تاريخ الافتتاح الرسمي 1923  إفتتا...

 

Rule of statutory interpretation Judicial interpretation Forms Constitutional interpretation Statutory interpretation General rules of interpretation Plain meaning rule Mischief rule Golden rule General theories of interpretation Living Constitution / Living tree / Living instrument Originalism (original meaning) Original intent(legislative intent, legislative history) Strict constructionism Textualism Purposive approach Common good constitutionalism Legal realism Legal process Legal formalis...

 

 Nota: Para outros significados, veja Oriente (desambiguação). Piscina do Harém, pintura orientalista de Jean-Léon Gérôme, c. 1876 O Oriente (do latim oriens, de oriri «nascer, surgir» [do «Sol»]) é um dos quatro pontos cardeais, sendo sinônimo de leste (ou este) e levante. Por extensão, é usado tradicionalmente para fazer referência a zonas do planeta Terra situadas a leste do meridiano de Greenwich, especificamente ao Extremo Oriente e ao Oriente Médio (também conhecid...

Coordenadas: 45° 22' N 7° 16' E Grosio    Comuna   Localização GrosioLocalização de Grosio na Itália Coordenadas 45° 22' N 7° 16' E Região Lombardia Província Sondrio Características geográficas Área total 127 km² População total 4 827 hab. Densidade 38 hab./km² Altitude 656 m Outros dados Comunas limítrofes Grosotto, Monno (BS), Sondalo, Valdidentro, Valdisotto, Vezza d'Oglio (BS) Código ISTAT 014033 Código cadastra...

 

Indian politician S. M. KrishnaKrishna as external affairs minister at the U.S. Department of State in Washington, D.C., June 3, 2011 .27th Minister of External AffairsIn office23 May 2009 – 28 October 2012Prime MinisterManmohan SinghPreceded byPranab MukherjeeSucceeded bySalman Khurshid18th Governor of MaharashtraIn office12 December 2004 – 5 March 2008Chief MinisterVilasrao DeshmukhPreceded byMohammed FazalSucceeded byS. C. Jamir10th Chief Minister of KarnatakaIn offic...

 

2014 film directed by Halitha Shameem This article needs a plot summary. Please add one in your own words. (January 2022) (Learn how and when to remove this template message) Poovarasam PeepeePosterDirected byHalitha ShameemWritten byHalitha ShameemProduced byManoj ParamahamsaSujatha Chenthilnathan StarringGaurav KalaiPravin KishoreVasanthCinematographyManoj ParamahamsaEdited byHalitha ShameemMusic byAruldevProductioncompaniesV TalkiesBaby Shoe ProductionsDistributed bySPI CinemasRelease date...

العلاقات الأندورية الجيبوتية أندورا جيبوتي   أندورا   جيبوتي تعديل مصدري - تعديل   العلاقات الأندورية الجيبوتية هي العلاقات الثنائية التي تجمع بين أندورا وجيبوتي.[1][2][3][4][5] مقارنة بين البلدين هذه مقارنة عامة ومرجعية للدولتين: وجه المقارنة ...

 

Filipino broadcaster Ernie BaronBornErnesto J. Baron(1940-08-15)August 15, 1940Bacoor, Cavite, PhilippinesDiedJanuary 23, 2006(2006-01-23) (aged 65)Muntinlupa, Metro Manila, PhilippinesResting placeAngelus Eternal Garden, Bacoor, Cavite, PhilippinesNationalityFilipinoOccupation(s)Broadcaster, weather presenterKnown forThe Philippine Walking Encyclopedia Ernesto J. Baron (August 15, 1940 – January 23, 2006), professionally known as Ka Ernie Baron, was a Filipino broadcaster and inv...

 

  هذه المقالة عن لغة أمازيغية. لمعانٍ أخرى، طالع أمازيغ (توضيح). أمازيغية صنهاجة الاسم الذاتي Tamaziɣt ⵜⴰⵎⴰⵣⵉⵖⵜ   الناطقون 50.000[1] (2013) الدول المغرب المنطقة شمال أفريقيا الكتابة تيفيناغ،  وإخطاطة لاتينية  النسب أفريقية آسيوية لغات أمازيغية شماليةلغات الأطلس...

Dutch sailor Cor GrootPersonal informationFull nameCornelis GrootNationalityDutchBorn(1909-01-21)21 January 1909AkerslootDied23 September 1978(1978-09-23) (aged 69)HaarlemHeight1.79 m (5.9 ft)Sailing careerClassDragon Updated on 2014-01-09. Cornelis Cor Groot (21 January 1909, Akersloot – 23 September 1978, Haarlem) was a sailor from the Netherlands, who represented his country at the 1968 Summer Olympics in Acapulco. Groot, as helmsman on the Dutch Dragon, took 10th pla...

 

Historic site in Queensland, AustraliaSt Andrew's Church, ToogoolawahSt. Andrew's Anglican ChurchLocation2 Mangerton Street, Toogoolawah, Somerset Region, Queensland, AustraliaCoordinates27°05′24″S 152°22′34″E / 27.0899°S 152.376°E / -27.0899; 152.376Design period1900 - 1914 (early 20th century)Built1911 - 1930ArchitectRobin Dods Queensland Heritage RegisterOfficial nameSt Andrew's ChurchTypestate heritage (built)Designated21 October 1992Reference no.6...

 

The viaduct from the east, with Waterfall Road on the right Location of the Arnos Park Viaduct Arnos Park Viaduct under construction, 1932 The Arnos Park Viaduct is a railway viaduct of 34 brick arches that was built as part of the extension of London Underground's Piccadilly line from Finsbury Park in the south to Cockfosters in the north. It was built in 1932 and opened in 1933. It starts on the southern edge of Arnos Park soon after Arnos Grove station and ends on the northern side of the ...

A view of the house in 2009, after its conversion to a Hampton Inns Hotel The house in 1905 The house in 1928 after being remodelated The Saint Augustine House is a landmark building located in the Historic center of Mexico City, on the corner of the streets Republic of Uruguay and 5 of February, (previously streets of Don Juan Manuel and la Joya respectively). It got its name as it was property of the order of the Augustinians, whose convent was located next to this building. History The ord...

 

Canon of Windsor and Archdeacon of Suffolk For other people named John Aleyn, see John Aleyn (disambiguation). This article relies largely or entirely on a single source. Relevant discussion may be found on the talk page. Please help improve this article by introducing citations to additional sources.Find sources: John Aleyn – news · newspapers · books · scholar · JSTOR (January 2015) John Aleyn (fl. 1360s; died 1373) was a Canon of Windsor from 1362 t...

 

Turkish seismic strike slip fault North Anatolian FaultThe North Anatolian Fault and slip magnitudes of earthquakes in the 20th centuryThe North Anatolian and neighbouring faults covering most of TurkeyCoordinates41°00′N 35°00′E / 41.000°N 35.000°E / 41.000; 35.000Country TurkeyRegionMarmara Region, Black Sea Region, Eastern Anatolia RegionCitiesIstanbul, Bursa, Bolu, Tokat, Erzincan, ErzurumCharacteristicsElevation3,937 metres (12,917 ft)Top depth1,3...

Musical group Ibrahim and Mike of Zule Zoo Zule Zoo is a Nigerian music duo that formed in the late 1990s by Michael Aboh and Al-Hassan Ibrahim who were both from Benue State.[1][2] They are known for their fusion of different musical genres such as traditional Nigerian rhythms, hip-hop, and reggae.[3] They became known after the success of their controversial hit song “Kerewa”, which was banned by the Nigerian Broadcasting Commission (NBC) for obscene content.[...

 

1903 All-Ireland Senior Football ChampionshipAll-Ireland ChampionsWinning teamKerry (1st win)All-Ireland FinalistsLosing teamKildareProvincial ChampionsMunsterKerryLeinsterKildareUlsterCavanConnachtMayoChampionship statistics← 1902 1904 → The 1903 All-Ireland Senior Football Championship was the 17th staging of Ireland's premier Gaelic football knock-out competition. In the Leinster Quarter final Kildare ended Dublin's period as All Ireland champions. Kerry won their first footbal...

 

Strategi Solo vs Squad di Free Fire: Cara Menang Mudah!