Johannes Bisterfeld teológus, filozófus és pedagógus fiaként született. Miután 1619-ben Heidelbergben befejezte teológiai tanulmányait, Genfben, a leideni és az oxfordi egyetemen tanult, majd az észak-brabanti Gravéban szolgált. 1629-ben a herborni egyetem professzora lett, és még ugyanebben az évben Bethlen Gábor fejedelem meghívta Johann Heinrich Alsteddel és Piscatorral együtt a gyulafehérvári főiskolára, ahol a teológiát és filozófiát adott elő. A fejedelem nemesi birtokot adományozott neki Tövisen; 1645-ben pedig házat vett Nagyszebenben. Alsted professzor lányát vette feleségül, akitől Susanna nevű lánya született, második felesége Johann Stenzel nagyszebeni tanácsos lánya volt.
Tudományos hírnevét teológiai és filozófiai írásaival szerezte, de a természettudományok területén is sokoldalúan tájékozott volt. Tanári és tudományos működése mellett I. Rákóczi György követeként is tevékenykedett. Könyvtárát a gyulafehérvári kollégiumra hagyományozta.
A nép fizikai kísérleteiért ördöngösnek tartotta; a népmonda szerint az ördögök tépték szét. A nagyenyedi kollégium ritkaságai között tartották számon Bisterfeld kapcsos ördögidéző könyvét, amely azonban az 1849. januári vérengzés során a könyvtárral együtt megsemmisült.
Művei
Disputatio philosophica de concursu causae primae cum secundis. Albae Juliae, 1630
De uno Deo patre, filio, ac spiritu sancto Misterium pietatis. Lugd. Batav., 1639 (és Amsterdamban 1659)
Elementa logica in usum scholae Albensis. Albae Julia, 1635 (2. k. 1641. 3. k. 1645. Uo. 4. bőv. k. Várad. 1649)
Disputatio theol. de domino nostro J. Christo. Albae Juliae, 1641
Disputatio theol. de divina Scripturae S. eminentia. Uo. 1641
Indices VII. ad Prodromum religionis triumphantis Johannis Henrici Alstedii (Uo. 1641)
Medulla priscae puraeque latinitatis. Uo. 1646 (Wendelin Marc. Frider. ezen munkáját az ifjuság számára kiadta s előszóval ellátta)
Seivert: Bisterfeld, Johann Heinrich. In Allgemeine Deutsche Biographie 2. Leipzig: Duncker & Humblot. 1875. 682–683. o.
Konrad Fuchs: Bisterfeld, Johann Heinrich. In Biographisch-Bibliographisches Kirchenlexikon (BBKL). Band 20. Nordhausen: (kiadó nélkül). 2002. 215–216. o.
Viskolcz Noémi: Johann Heinrich Bisterfeld (1605–1655) bibliográfia / A Bisterfeld-könyvtár; OSZK–Scriptum, Bp.–Szeged, 2003 (A Kárpát-medence kora újkori könyvtárai)