Musztafa 1591-ben született III. Mehmed fiaként.[1]1603-ban, fivére, I. Ahmed trónraléptekor – az addigi szokással ellentétben – nem ölette meg testvérét. Mithogy állítólag szellemileg vissza volt maradva, soha nem volt több, mint egy játékszer a Topkapı palotabeli összeesküvésekben. Ahmed uralkodása alatt szobafogságban szenvedett 14 évig.
Első uralkodása
1617-ben, bátyja halála után lépett trónra. 1618-ban egy kierőszakolt fetva alapján őrültnek nyilvánították[2] – hogy unokaöccsét, II. Oszmánt emeljék szultánná.
Második uralkodása
Oszmán megbuktatása után, 1622-ben anyja segítségével visszavette a hatalmat és még egy évig uralkodott. Végül Köszem szultána1623-ban megdöntötte hatalmát, a trónra kiskorú Murád fiát ültette, magát pedig kormányzóvá nevezte ki. Musztafát haláláig bebörtönözve tartotta.