A törökországi Erzurum közelében ered. Digortól délkeletre veszi fel az Arpaçay folyó vizét a régi örmény főváros, Ani szomszédságában, ezután a török-örmény határon folyik, majd elhalad a Törökországot az azerbajdzsáni Nahicsevánexklávéval összekötő korridor közelében. Ezután az iráni-nahicseváni, majd az iráni-örmény határon folyik, később az iráni-azerbajdzsáni határon, majd behatol Azerbajdzsánba, ahol Szabirabad falunál a Kurával (Azerbajdzsánban Kür) találkozik. A folyó neve innentől Kür, mert a Kura vízgyűjtője ugyan kisebb, de a két folyó találkozásánal vízszintje kétszer magasabb az Arakszénál.
Jobb oldali (déli) fő mellékfolyói: Zangmar, Szariszo, Ghotour, Hadzsilar, Kalibarr, Ilghena, Darreh és Balha. Bal oldali (északi) mellékfolyói: Ghareszo, Arpaçay, Metszamor, Hrazdan, Azat, Vedi, Arpa, Vorotan, Voghdji, Megri, Khacsin, Okhcsi, Kuri és Kandlan.[1]