A 2009-es japán nagydíj volt a 2009-es MotoGP-világbajnokság második futama. A versenyt Motegiben rendezték április 26-án. A verseny volt a gyorsaságimotoros-világbajnokság 700. nagydíja.[1] A királykategória versenyét Jorge Lorenzo nyerte csapattársa, Valentino Rossi előtt, így az összetettben is az élre állt.[2][3]
Az időmérőt mindhárom kategóriának törölni kellett, így a rajtsorrendet a szabadedzéseken elért átlagolt idő döntötte el.[4][5][6]