En 2014, elle quitte le service public pour le groupe Canal+ et fait ses armes au sein de la chaîne d’info I-Télé[4]. Fin 2015, elle rejoint Canal+ pour présenter les journaux de La Nouvelle Édition durant le congé maternité de la présentatrice titulaire Émilie Besse[5].
De à 2020, Émilie Tran Nguyen présente chaque mercredi à 22h30 l'émission Ouvrez le 1 aux côtés d'Éric Fottorino[7]. Diffusée sur France Info, l'émission est élaborée en partenariat avec l'hebdomadaire Le 1 dont Éric Fottorino est le cofondateur[8].
Pendant le premier confinement de 2020, elle présente le magazine d'investigation de France 3, Pièces à conviction et remplace exceptionnellement Virna Sacchi qui en raison des règles du confinement, ne peut pas quitter les Hauts-de-France où elle travaille habituellement[11].
En , Émilie Tran Nguyen prend la suite de Maxime Switek dans l'émission C à vous, et est responsable de la chronique d'actualité « 5 sur 5 »[12]. Elle est remplacée la saison suivante par Matthieu Belliard, mais elle reste chroniqueuse dans l'émission pour une chronique consacrée à un fait d'actualité[13]. Du 17 au 26 mai 2023 elle présente C à vous en remplacement d'Anne-Élisabeth Lemoine qui présente C à vous, la suite délocalisée au Festival de Cannes 2023[14].
Le 7 juillet 2023, elle présente son dernier 12/13 National, la direction de l'information ayant décidé de supprimer les éditions nationales du journal pour confier la réalisation des journaux aux stations régionales uniquement[15],[16].
À partir du 4 septembre 2023, elle remplace Marianne Théoleyre à la présentation de la tranche 12 h - 13 h de la chaîne d'information en continu Franceinfo[17]. À partir du 22 avril 2024, la tranche est rallongé de 11 h à 13 h[18]. En parallèle, dans C à vous, elle n’intervient plus que deux fois par semaine, les jeudis et vendredis[19]. Après le départ d’Aurélie Casse de l’émission[20], elle y intervient de nouveau du lundi au vendredi, à partir de janvier 2024[21].
En février 2024, elle coréalise avec Jessica Bagic le documentaire « Je ne suis pas chinetoque » - Histoire du racisme anti-asiatique[22].
En l'absence de Maya Lauqué, elle présente Télématin les week-ends du 17 et 24 février 2024[23]. Par la suite, dès le mois de mai 2024, elle remplace Marie Portolano, d’abord lors de ses congés puis lors de son congé maternité[24],[25].
En , elle participe à la campagne #AsiatiquesDeFrance, dénonçant les clichés sur la communauté asiatique de France[27].
Elle est la marraine de la promotion 2021 de La Chance, une préparation aux concours des écoles de journalisme destinée aux étudiants boursiers visant à une meilleure représentation sociale et ethnique de la société dans les médias. Elle motive cette décision par son parcours personnel auprès des étudiants en déclarant que « ce monde-là m’était étranger. Il me semblait impossible à rejoindre »[28].
Vie privée
Elle est mariée avec Maxime Darquier, chroniqueur à C politique sur France 5 depuis [29]. Elle est mère d'une fille née le , prénommée Ava[30] et d'un garçon prénommé Pio, né le 9 juin 2022[31].
Documentaires
2024 : « Je ne suis pas chinetoque » - Histoire du racisme anti-asiatique, co-réalisé avec Jessica Bagic