Les travaux commencent en 1861 sur les plans de l'architecte Adrien-Louis Lusson à qui Joseph Uchard succède à sa mort en 1864. Les pierres aux grains fins et serrés utilisées dans la construction proviennent des carrières souterraines de Bagneux[3].
L'édifice est achevé en 1873, à l'exception de sa décoration intérieure. L'église est ouverte au culte en 1874 puis consacrée le .
Transfert de la châsse de sainte Madeleine-Sophie Barat
La châsse contenant le corps de sainte Madeleine-Sophie Barat, fondatrice en 1800 de la Société du Sacré-Cœur de Jésus (Congrégation des sœurs du Sacré-Cœur) est transférée dans cette église le vendredi , fête du Sacré-Cœur[4],[5]. C'est donc ce jour-là qu'a lieu une très importante cérémonie, présidée par le cardinal André Vingt-Trois, archevêque de Paris, entouré de Georges Gilson, archevêque émérite de Sens-Auxerre, Yves Patenôtre, archevêque titulaire de Sens-Auxerre, Antoine Hérouard, secrétaire général de la Conférence des évêques de France, Patrick Chauvet, curé de Saint-François-Xavier, d'une quarantaine de prêtres, de quelques centaines de religieuses de la Société du Sacré-Cœur de Jésus, et de plus de 1 000 fidèles[6],[5]. La direction de la congrégation avait en effet décidé d'installer la châsse dans cette église qui se trouve à côté des bâtiments où Madeleine-Sophie Barat a vécu : le siège de la congrégation (aujourd'hui musée Rodin) et l'établissement d'enseignement pour les jeunes filles, aujourd'hui lycée Victor-Duruy[5].
La chapelle du Sacré-Cœur où a été installée la châsse, le .
Les orgues ont été construits en 1878 par la maison Fermis et Persil, révisés par Cavaillé-Coll en 1890, puis par le mécanicien Ephrem et le facteurGonzalez en 1923. Bernard Dargassies les a entièrement restaurés en 1993[8]. Les orgues restaurés ont été inaugurés le [9].
D'un plan classique, l'église possède une armature métallique permettant à la voûte de reposer directement sur les murs latéraux. Il n'y a donc ni bas-côtés, ni arcs boutant. Des chapelles latérales ponctuent les côtés, alors que la chapelle axiale accueille une statue de la Vierge réalisée par Jean-Marie Bonnassieux[1].
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L'église est le lieu de culte de la paroisse « Saint-François-Xavier-des-Missions-Étrangères » depuis 1842. Avant la construction de l'église, son lieu de culte était l'actuelle chapelle de l'Épiphanie des Missions étrangères de Paris située 128, rue du Bac.
L'équipe sacerdotale en 2018 est composée, outre de son curé, de trois vicaires, de trois jeunes prêtres en mission d'études, d'un aumônier, d'un prêtre rattaché, ainsi que de deux diacres permanents. Le conseil pastoral dirigé par le curé est composé de vingt membres, dont douze laïcs, cinq prêtres et deux diacres permanents. Le conseil économique paroissial, nommé après accord de l'archevêché, comprend sept membres dont six laïcs avec le délégué diocésain[13].
↑Louis Lazare Perruchot a été nommé par la suite en 1904 maître de chapelle de la cathédrale de Monaco
↑Pierre de saint Jorre a été nommé titulaire de l'orgue de chœur en 1952 avant de devenir maître de chapelle en 1957 à la mort de Dieudonné Guiglaris
↑Né à Millau le 20 janvier 1826, l'abbé Rivié sera curé de Saint-François-Xavier jusqu'au jour de sa mort le 2 juillet 1897. C'est sous son autorité que son vicaire Louis Esquerré fonde le patronage du Bon Conseil en 1894.
↑Alain Castet est nommé évêque de Luçon le 14 avril 2008.
↑Patrick Chauvet est nommé « recteur archiprêtre de la Basilique métropolitaine Notre-Dame de Paris », charge effective au .
↑Schola cantorum (Paris) Auteur du texte, La Tribune de Saint-Gervais : bulletin mensuel de la Schola cantorum / directeur Charles Bordes, Schola cantorum, (lire en ligne)
↑Alexis Galpérine, Denis Havard de la Montagne, « Eugène Borrel », sur www.musimem.com (consulté le )