La saison 2012-2013 de l'AC Ajaccio est la 95e saison du club. Il s'agit de sa deuxième saison de suite parmi l'élite depuis 2011. C'est la 12e saison en Ligue 1 dans l'histoire du club. Alain Orsoni dispute sa cinquième saison en tant que président, et Alex Dupont fait sa première saison au club. Cette saison voit le club s'engager dans trois compétitions que sont la Ligue 1, la Coupe de France et la Coupe de la Ligue.
A L'AC Ajaccio a commencé la saison avec 2 points de pénalité (plus 1 avec sursis) à la suite d'incidents survenus lors du match Ajaccio-Lyon de la saison précédente[3].