La première épouse de Barringer, Eugenia Morrison Barringer, meurt de la fièvre typhoïde en 1858, quatre ans après leur mariage. Ils ont eu deux enfants, Paul et Anna. Deux autres sœurs d'Eugenia épousent aussi des futurs généraux de la guerre de Sécession, Stonewall Jackson et D. H. Hill. En 1861, Barringer se remarie, cette fois avec Rosalie Chunn d'Asheville, qui lui donne un fils, Rufus Clay Barringer, Jr. Rosalie décède en 1864.
Barringer est promu brigadier général le , et reçoit le commandement de la brigade de cavalerie de Caroline du Nord jusqu'à sa capture lors de la bataille de Namozine Church en Virginie, le . Après une brève entrevue avec le président Abraham Lincoln derrière les lignes de l'Union à City Point, en Virginie, il est envoyé au fort Delaware comme un prisonnier de guerre. Lincoln, un ami personnel et les anciens collègue du Congrès du frère de Barringer, donne une note au secrétaire de la Guerre, Edwin M. Stanton demandant un traitement spécial pour Barringer en captivité. Malheureusement, la faveur de Lincoln tourne mal. Après l'assassinat de Lincoln, Barringer est suspecté en raison de sa brève rencontre avec lui moins de deux semaines avant. Il est interrogé à plusieurs reprises à propos d'un éventuel rôle qu'il aurait joué dans la conspiration. Il ne sort pas de garde à vue avant la fin de juillet, un mois après la plupart la libération des autres prisonniers confédérés. Pendant la guerre, il a combattu lors de soixante-six engagements et a été blessé à trois reprises.
Après-guerre
Barringer retourne en Caroline du Nord en août et ouvre un cabinet d'avocat à Charlotte. Il est aussi propriétaire d'un fermage et contribue à étendre le système ferroviaire de l'État. Il se marie de nouveau en 1870, prenant mademoiselle Margaret Long du comté d'Orange, en Caroline du Nord, comme troisième femme. Ils ont un fils, Osmond L. (1878-1961). Barringer est délégué à la convention constitutionnelle de la Caroline du Nord de 1875. Il est candidat malheureux au poste de lieutenant-gouverneur en 1880, en tant que républicain, perdant face à James L. Robinson. Il prend sa retraite d'avocat en 1884, et devient écrivain, écrivant une histoire du 9th North Carolina Cavalry.
Sa tombe est dans le cimetière d'Elmwood à Charlotte[2].
Barringer, Sheridan R., Fighting for General Lee: Confederate General Rufus Barringer and the North Carolina Cavalry Brigade, Savas Beatie, 2016, (ISBN978-1-61121-262-4).
Richard Owen et James Owen, Generals at Rest: The Grave Sites of the 425 Official Confederate Generals, Shippensburg, PA, White Mane Publishing Co., (ISBN1-57249-045-4)
Warner, Ezra J., Generals in Gray: Lives of the Confederate Commanders, Louisiana State University Press, 1959, (ISBN0-8071-0823-5).
Marquis Who's Who, Inc. Who Was Who in American History, the Military. Chicago: Marquis Who's Who, 1975. (ISBN0837932017) (OCLC657162692)