Avant 1780, époque à laquelle elle fut créée, c'était un ancien chemin longeant le Grand Égout de ceinture.
Cette rue est ouverte en 1780, sous le nom de « rue des Petites-Écuries-du-Roi[1] », sur le Grand Égout de ceinture qui fut canalisé en 1740 et couvert sur cette portion en 1769[2].
Sous la Révolution la « rue des Petites-Écuries-du-Roi » est devenue la « rue des Petites-Écuries ».
Le , un forcené a retenu deux personnes en otage qui ont été finalement saines et sauves. Ses motivations sont restées floues[3].