Pendant cette période, il compose des œuvres de musique instrumentale de style néoclassique, avant d'adopter des techniques dodécaphoniques. En 1958, il participe aux cours de John Cage à la New School for Social Research. Il y enseigne en 1959, devenant le premier Américain à enseigner la musique purement électronique, ne s'appuyant pas sur des enregistrements de musique instrumentale. Il met au point par la suite des techniques de composition utilisant des bandes magnétiques, qui sont décisives dans l'évolution de son style. Il introduit, entre autres innovations, l'interprétation simultanée de solos instrumentaux et d'enregistrements basés sur des échantillons interprétés par le même soliste, la modification des enregistrements avant chaque interprétation de façon que les pièces ne soient pas fixées dans une forme unique, ainsi que l'utilisation de la touche « effacer » du magnétophone comme source sonore. Il participe à Fluxus, et organise des concerts dans le cadre de ce mouvement, dans le loft de Yoko Ono, avec La Monte Young, dont il est proche. Il a enregistré un grand nombre de pièces électroniques minimalistes, mais peu d'entre elles ont connu une diffusion commerciale.
En 1967, il laisse son matériel d'enregistrement et ses participations à son ami Walter De Maria. Il s'installe d'abord à San Francisco, où il enseigne à l'université d'État de San Francisco, puis à Los Angeles, où, souffrant de problèmes d'addiction aux stupéfiants qui vont en s'aggravant, il se suicide en 1969, en sautant par une fenêtre de l’hôtel Figueroa à l’âge de 42 ans[1].
