Le , il est annoncé que Määttä doit subir une opération chirurgicale pour enlever une tumeur à la glande thyroïde, tumeur qui a de grandes chances d'être cancéreuse. La masse a été détectée par le personnel médical des Penguins au cours des tests physiques au camp d’entraînement. Cette opération doit le tenir à l’écart du jeu pendant 4 semaines après la chirurgie[4]. Finalement, il est opéré le et revient au jeu dès le , à la suite d'une récupération très rapide[5],[6]. Le , Määttä se blesse à nouveau à l'épaule qui a été opéré durant l'inter-saison, ce qui lui fait manquer 16 matchs avant que l'équipe n'annonce le la fin de sa saison[7]. Il devra en effet être à nouveau opéré pour réparer son épaule, alors qu'il est également diagnostiqué avec les oreillons (à la suite de l'épidémie de 2014-2015)[8].
La saison 2015-2016 suivante, il subit une blessure très impressionnante lors d'une charge dans le dos par Nino Niedrreiter qui l'envoie contre la bande, devant le banc du Wild du Minnesota, dont la porte n'était pas fermée avec un loquet. Cette dernière s'ouvre sous l'impact et il entre en contact dans l'angle créé. Même s'il doit être porté pour sortir, il ne souffrira que d'une déchirure musculaire et des tissus mous, manquant 4 semaines de jeu[9]. La même année, alors que les Penguins sont en série éliminatoire, Brooks Orpik le charge en retard et à la tête, ce qui lui vaut une suspension de trois matchs[10]. Määttä revient au jeu quelques matchs plus tard et termine la série, jouant jusqu'à la finale qui lui permet de remporter sa première Coupe Stanley.
La saison suivante, il manque 6 semaines à cause d'une main cassée lors du match du [11] contre les Jets de Winnipeg, manquant 24 matchs[12]. Il joue les séries éliminatoires pour remporter la seconde Coupe Stanley de sa carrière.
Le , il joue son 300e match en LNH[13]. Pour la première fois depuis longtemps, il joue les 82 matchs de la saison régulière et enregistre 29 points, le meilleur score de sa carrière[14].