Élu professeur de philosophie morale et de métaphysique à Yale en 1846, Porter est intronisé président de l'université Yale le mercredi [4]. Il occupe ce poste jusqu'en 1886.
Porter édite plusieurs éditions du dictionnaire Webster et écrit plusieurs textes sur l'éducation.
Influencé par l'écrivain réfugié et philosophe allemand Francis Lieber, Porter s'oppose à l'esclavagisme et intègre une position de lutte contre l'esclavage avec le libéralisme religieux.
Son livre le plus connu est intitulé The Human Intellect avec Introduction upon Psychology and the Human Soul (1868),
comprenant une histoire générale de la philosophie et suivant en partie la philosophie de l'école écossaise tout en acceptant la doctrine de l'intuitionkantienne. Il déclare que la notion de dessein est a priori. Deux autres de ses livres, Elements of Intellectual Science (1871) et Elements of Moral Science (1885) sont également importants.