Ancien protectorat britannique, l'Ouganda obtient son indépendance le , la reine Élisabeth II restant chef de l'État et portant le titre spécifique de reine d'Ouganda. La majorité de ses pouvoirs constitutionnels sont exercés par le gouverneur général, qui est son représentant dans le pays. En effet, comme d'autres pays du Commonwealth, le système politique d'Ouganda est basé sur le système de Westminster, dans lequel le chef de l'État joue un rôle purement honorifique.
La monarchie est abolie le , date à laquelle le pays devient une république tout en continuant de reconnaître la reine Élisabeth II comme chef du Commonwealth. Un président remplace la reine comme chef d'État.
Après l'indépendance de l'Ouganda en 1962, aucun ministre du gouvernement du Royaume-Uni ne peut conseiller la reine sur les questions relatives à l'Ouganda[6]. Pour toutes les affaires ougandaises, la souveraine est conseillée uniquement par ses ministres ougandais. La reine est représentée dans le pays par un gouverneur général nommé par elle sur avis du Premier ministre de l'Ouganda. Théoriquement, la reine détient de vastes pouvoirs constitutionnels, mais en pratique, tous ces pouvoirs sont exercés par le gouverneur général.
Le monarque et l'Assemblée nationale constituent le Parlement de l'Ouganda[7]. Tous les textes de loi ougandais doivent recevoir la sanction royale pour être promulgués ; celle-ci est accordée par le gouverneur général au nom de la reine. Il est chargé de convoquer, de proroger et de dissoudre le Parlement. Le gouverneur général nomme les ministres sur avis du Premier ministre[8].
La reine Élisabeth II possède officiellement un titre différent dans chacun des royaumes du Commonwealth. Jusqu'en 1962, l'Ouganda fait partie de l'Empire britannique, et Élisabeth II y règne en tant que reine du Royaume-Uni[9]. Après l'indépendance, un nouveau titre est adopté, afin de préciser l'aspect distinct de la monarchie ougandaise. À partir du , le titre de la reine en Ouganda est le suivant[9] :
« Elizabeth the Second, by the Grace of God, Queen of Uganda and of Her Other Realms and Territories, Head of the Commonwealth. »
« Élisabeth Deux, par la grâce de Dieu, reine d'Ouganda et de ses autres royaumes et territoires, chef du Commonwealth. »
Entre le et le , la reine conserve son titre britannique : « Élisabeth Deux, par la grâce de Dieu, reine du Royaume-Uni de Grande-Bretagne et d'Irlande du Nord et de ses autres royaumes et territoires, chef du Commonwealth, défenseur de la Foi »[9].