En dehors du premier kilomètre de son cours, le ruisseau s'écoule dans un ravin profond de 100 à 200 mètres, dont le versant ouest est le plus abrupt. Le Merdanson suit une direction globale nord-est/sud-ouest[4], sauf sur ses derniers 300 mètres, où il oblique vers le sud-est, passe sous la route départementale 19 au pont de Lous, avant de rejoindre aussitôt le Lot en rive droite, à 407 mètres d'altitude, dans la retenue du barrage de Castelnau-Lassouts, sur la commune de Sainte-Eulalie-d'Olt.
Sur la quasi-totalité de son cours, il sert de limite aux communes qu'il borde : Saint Geniez d'Olt et d'Aubrac à l'est, et Prades-d'Aubrac puis Sainte-Eulalie-d'Olt — sur moins de 200 mètres — à l'ouest.
Son bassin versant est inclus dans un bassin beaucoup plus étendu de 1 724 km2 : « Le Lot du confluent du Merdanson (inclus) au confluent du Lauras (O723) »[1], constitué à 64.13 % de « forêts et milieux semi-naturels », à 34.65 % de « territoires agricoles », et à 0,23 % de « territoires artificialisés »[1].
Organisme gestionnaire
L'organisme gestionnaire est l'EPTB « Entente interdépartementale du bassin du Lot »[2].
Affluents
Selon le SANDRE, le Merdanson a neuf affluents répertoriés dont six, tous situés en rive gauche, portent un nom :