Après de bons résultats au niveau amateur, Jarno Vanfrachem passe professionnel en 1997 dans la structure Vlaanderen 2002. Pour sa première avec l'équipe, il prend la deuxième du Ronde van Zuid-Holland. Il décroche également deux tops dix au sprint sur des étapes du Tour de l'Avenir. L'année suivante, il obtient quelques podiums dans des kermesses belges. Il redescend ensuite chez les amateurs, où il continue sa carrière. Durant cette période, il devient champion de Belgique des élites sans contrat en 2001 et en 2003. Il brille par ailleurs sur diverses éditions du Tour de Namur et du Tour du Brabant flamand[3].