Inigo Jones est né à Smithfield, dans les environs de Londres vers 1573 ; on ne connaît précisément que sa date de baptême : le . Fils d'un ouvrier tailleurcatholiquegallois, il porte comme son père le prénom rare en anglais d'Inigo, dérivé d’Íñigo », prénom espagnol d’Ignace de Loyola, fondateur en 1539 des Jésuites. On sait peu de chose sur sa jeunesse : il étudie et obtient ses diplômes en Angleterre, et se montre particulièrement doué pour les arts décoratifs.
De retour en Grande-Bretagne, Jones est nommé par le roi Jacques Ier d'Angleterre « surveyor of the King works ». Véritable maître des cérémonies de la cour royale, il réalise en particulier avec l'auteur dramatique Ben Jonson une série de divertissements de cour dénommés Masques. Inigo Jones réalise les dessins des costumes, des décors et met au point les effets spéciaux. Cette collaboration a un grand succès à la cour. Inigo Jones et Ben Jonson se brouilleront et Ben Jonson réalisera plusieurs portraits satiriques de Jones dans ses pièces. On y retrouvera Inigo Jones sous les traits du « Général Vitruvius ».
En 1620, à l'instigation du roi Jacques Ier, Jones réalise une étude sur Stonehenge, qu'il mesure, dessine, et il avance une théorie fondée sur la géométrie d’un temple toscan archaïque, aujourd'hui abandonnée, mais intéressante du point de vue historiographique[1].