Le bourg fut fortifié par l’évêque Eberhard von Waldburg en 1251. Il acquit le droit de marché à la fin du XVIIe siècle.
Pendant le Concile de Constance, en 1415, le réformateur tchèque Jan Hus et l'antipape Jean XXIII, déposés par l'Église, croupirent dans les oubliettes du château.
De 1798 à 1874, Gottlieben fut le chef-lieu de district. Depuis 1874, ce rôle est dévolu à Kreuzlingen.
Économie
La principale activité de la commune est le tourisme. Le lieu est en outre connu pour ses Gottlieber Hüppen, douceurs de pâte à gaufre fourrée au praliné ou au nougat.