Gert Kams compte 41 sélections et 2 buts avec l'équipe d'Estonie depuis 2007[3].
Il est convoqué pour la première fois par le sélectionneur national Jelle Goes pour un match amical contre la Pologne le (défaite 4-0). Par la suite, le , il inscrit son premier but en sélection contre le Salvador, lors d'un match amical (victoire 2-0)[4].