Le 6 avril 1726, Wise est élu gardien des archives(en)(Keeper of the Archives) de l'université d'Oxford. La même année, il reçoit de son élève Francis North (fils du baron Guildford) la cure d'Elsfield, à quelques kilomètres d'Oxford, qui devient sa résidence principale. Contrairement à ses prédécesseurs, il ne travaille par sur les archives de l'université. Ses publications se concentrent sur d'autres domaines, notamment la numismatique et les études anglo-saxonnes. Sa première publication est une édition de la Vita Ælfredi regis d'Asser (1722), dans laquelle il s'efforce (avec l'aide de Humfrey Wanley et James Hill) de débarrasser le texte original des interpolations effectuées par Matthew Parker et William Camden. En 1750, il publie un catalogue des monnaies conservées à la bibliothèque bodléienne. Un projet d'édition du manuscrit Junius en collaboration avec Edward Lye, Edward Rowe Mores et George Ballard(en) échoue pour des raisons financières dans les années 1750[1].
En 1748, Francis Wise est élu premier bibliothécaire de la bibliothèque Radcliffe, aujourd'hui connue sous le nom de Radcliffe Caméra (Oxford)[2].
Frappé de goutte, Francis Wise meurt en 1767, à l'âge de 72 ans. Il est inhumé à Elsfield[1].
Publications
1722 : Annales rerum gestarum Ælfredi Magni auctore Asserio Menevensi
1750 : Nummorum antiquorum scriniis Bodleianis reconditorum catalogus
1758 : Some Enquiries Concerning the First Inhabitants, Language, Religion, Learning and Letters of Europe
1764 : The History and Chronology of the Fabulous Ages Considered
