Le départ de la course est donné depuis sa création à Huy en haut du mur. L'arrivée est toujours située en haut du mur de Huy. Le parcours de la course féminine correspond à la fin du parcours masculin. Ainsi en 2011, les hommes effectuent une partie en ligne depuis Charleroi avant d'arriver à Huy et de réaliser deux boucles. Les femmes effectuent uniquement ces deux dernières boucles (voir cartes ci-dessous).
Parcours masculin 2011
Parcours féminin 2011
Le parcours a connu de nombreux changements. Couru tout d'abord en une seule boucle de 1998 à 2009. Elle est constituée de 2010 à 2012 d'une grande boucle suivie d'une petite boucle. Durant ces deux périodes, le parcours va vers le sud jusqu'à Havelange où il tourne vers le nord et Andenne avant de revenir vers Huy. À partir de 2013, deux boucles d'un même circuit sont parcourues. Le parcours va d'abord chercher la côte d'Ereffe avant de se diriger vers Andenne puis Huy. La longueur du parcours a augmenté progressivement avec le temps. Longue d'environ 95 km de 1999 à 2004, sa longueur est proche de 100 km de 2005 à 2009. À partir de 2010, la longueur augmente significativement : 109 km en 2010 puis 131,5 km en 2013 et 137 km en 2016[1].
Côtes
La Flèche wallonne féminine est une course vallonnée. Les côtes parcourues ont une importance décisive sur la morphologie de la course. Certaines sont récurrentes. Ainsi le mur de Huy est systématiquement parcouru. La côte de Bohissau est empruntée de la création de l'épreuve à 2016 sans interruption. La carte ci-contre liste toutes les côtes présentes sur le parcours depuis la création de l'épreuve. Elles sont numérotées dans un ordre correspondant approximativement à leur ordre sur le parcours. Le parcours de l'édition 1998 est mal connu.
2: indique que la côte a été montée deux fois durant cette édition.
Déroulement
La Flèche wallonne est la course de côte par excellence. S'il y a souvent des échappées, elles sont très rarement victorieuses. L'édition 2004 est la seule exception. Hanka Kupfernagel et la vainqueur Sonia Huguet sortent en effet à six kilomètres de l'arrivée[2]. Généralement, la plupart des équipes tentent d'obtenir un peloton, ou du moins un groupe, groupé au pied de la dernière ascension du mur de Huy dans lequel tout se joue. On notera que de 2015 à 2017, la course se lance avant le mur de Huy, dans la côte de Cherave, à cinq kilomètres de l'arrivée.
Primes
En 2021, les primes de l'édition féminine ne sont pas à la hauteur de celle de l'édition masculine : quand l'élite homme se partage un total de 43 000 euros, dont 16 000 euros pour le vainqueur, leur consœurs du peloton féminin se partage un total de 9 005 euros, dont 1 535 euros pour la gagnante du jour[3].