FTO (gène)

FTO
Structures disponibles PDB Recherche d'orthologue: PDBe RCSB Identifiants PDB 3LFM, 4IDZ, 4IE0, 4IE4, 4IE5, 4IE6, 4IE7, 4CXW, 4CXX, 4CXY, 4QHO, 4QKN, 4ZS3, 4ZS2
Identifiants
Aliases	FTO
IDs externes	OMIM: 610966 MGI: 1347093 HomoloGene: 8053 GeneCards: FTO
Position du gène (Homme) Chr. Chromosome 16 humain[1] Locus 16q12.2 Début 53,701,692 bp[1] Fin 54,158,512 bp[1]
Position du gène (Souris) Chr. Chromosome 8 (souris)[2] Locus 8 C5|8 44.34 cM Début 92,040,153 bp[2] Fin 92,395,067 bp[2]
Expression génétique Bgee Humain Souris (orthologue) Fortement exprimé dans cellule épithéliale bronchiale Brodmann area 10 gyrus frontal moyen frontal pole Pars compacta corps calleux dorsal motor nucleus of vagus nerve canal galactophore inferior olivary nucleus Brodmann area 46 Fortement exprimé dans tubercule génital Aire tegmentale ventrale colliculus supérieur dorsal tegmental nucleus dorsomedial hypothalamic nucleus habenula pontine nuclei tail of embryo Subiculum colliculus inférieur Plus de données d'expression de référence BioGPS Plus de données d'expression de référence
Gene Ontology Fonction moléculaire oxidative DNA demethylase activity dioxygenase activity liaison ion métal DNA-N1-methyladenine dioxygenase activity activité d'oxydoréductase ferrous iron binding mRNA N6-methyladenosine dioxygenase activity oxidative RNA demethylase activity Composant cellulaire nuclear speck noyau nucléoplasme Processus biologique regulation of multicellular organism growth regulation of respiratory system process regulation of white fat cell proliferation cellular response to DNA damage stimulus oxidative demethylation oxidative single-stranded RNA demethylation regulation of lipid storage RNA repair adipose tissue development DNA demethylation regulation of brown fat cell differentiation temperature homeostasis oxidative single-stranded DNA demethylation réparation de l'ADN DNA dealkylation involved in DNA repair Sources:Amigo / QuickGO
Orthologues Espèces Homme Souris Entrez 79068 26383 Ensembl ENSG00000140718 ENSMUSG00000055932 UniProt Q9C0B1 Q8BGW1 RefSeq (mRNA) NM_001080432 NM_011936 RefSeq (protéine) NP_001073901 NP_001350820 NP_001350823 NP_001350825 NP_001350826 NP_001350827 NP_001350828 NP_001350829 NP_001350830 NP_001350832 NP_001350834 NP_001350917 NP_036066 Localisation (UCSC) Chr 16: 53.7 – 54.16 Mb Chr 8: 92.04 – 92.4 Mb Publication PubMed [3] [4]
Wikidata
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Le FTO (pour « Fat mass and obesity-associated protein ») est un gène situé sur le chromosome 16 humain et dont certains variants sont associés avec une obésité.

En médecine

Un variant correspondant, sous forme homozygote, à 16 % de la population, est corrélé avec un poids augmenté et à risque majoré d'obésité, débutant dès l'enfance^[5]. L'inactivation du gène, sur un modèle animal, semble protéger contre le surpoids^[6]. Le mécanisme de cet effet n'est pas clair et pourrait faire intervenir l'expression de l'IRX3^[7], du RBL2^[8] ainsi que du SOX4 et du HHEX, les deux derniers intervenant dans la régulation de la sécrétion d'insuline^[9]. Il jouerait également sur la régulation de la thermogenèse par les adipocytes^[10].

En agronomie

L'ajout de ce gène dans les plants de pomme de terre ou de riz leur a permis de développer des racines plus longes, une photosynthèse plus efficace et une résistance à la sècheresse accrue^[11].

Notes et références

1. GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000140718 - Ensembl, May 2017
2. GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000055932 - Ensembl, May 2017
3. « Publications PubMed pour l'Homme », sur National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine
4. « Publications PubMed pour la Souris », sur National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine
5. Frayling TM, Timpson NJ, Weedon MN et al. A common variant in the FTO gene is associated with body mass index and predisposes to childhood and adult obesity, Science, 2007;316:889-894
6. Fischer J, Koch L, Emmerling C et al. Inactivation of the Fto gene protects from obesity, Nature, 2009;458:894-898
7. Smemo S, Tena JJ, Kim KH et al. Obesity-associated variants within FTO form long-range functional connections with IRX3, Nature, 2014;507:371-375
8. Jowett JB, Curran JE, Johnson MP et al. Genetic variation at the FTO locus influences RBL2 gene expression, Diabetes, 2010;59:726-732
9. Ragvin A, Moro E, Fredman D et al. Long-range gene regulation links genomic type 2 diabetes and obesity risk regions to HHEX, SOX4, and IRX3, Proc Natl Acad Sci U S A, 2010;107:775-780
10. Claussnitzer M, Dankel SN, Kim KH et al. FTO obesity variant circuitry and adipocyte browning in humans, N Engl J Med, 2015;373:895-907
11. Céline Deluzarche, « Ajouter un gène humain aux plantes dope leur rendement de 50 % », sur Futura (consulté le 4 août 2021)

Liens externes

• Ressource relative à la santé :
  • Héritage mendélien chez l'humain