Après l'extinction de la branche de Bavière-Straubing, en 1425, Ernest et Guillaume III obtiennent une part des terres concernées, dont la ville de Straubing elle-même.
Amalie (1408-1432), nonne au cloître Sainte-Clara de Munich
La guerre de Bavière débuta à partir de 1420 et s'acheva en 1422, lorsqu'Ernest battit Louis VII à la bataille d'Alling(de). Après la disparition de la ligne Bavière-Straubing en 1425, la guerre éclata à nouveau en Bavière. Ernest et Guillaume III ont réussi à en sortir vainqueurs et ont pu ajouter une grande partie de la Bavière-Straubing à leur territoire en 1429.
En , Ernest fait condamner pour sorcellerie et noyer la maîtresse de son fils Albert, la roturière Agnès Bernauer. Celui-ci s'enfuit à la cour d'Ingolstadt, auprès de son cousin Louis VII de Bavière, mais finit par se réconcilier avec son père. Il lui succède à sa mort, en 1438.
Ernest fut enterré en l'église Notre-Dame de Munich.