La saison 1999-2000 du championnat de France de basket-ball de Pro A est la 78e édition du championnat de France de basket-ball, la 13e depuis la création de la LNB.
Le championnat de Pro A de basket-ball est le plus haut niveau du championnat de France.
Seize clubs participent à la compétition. À la fin de la saison régulière, les équipes classées de 1 à 8 sont automatiquement qualifiées pour les quarts de finale des playoffs. Le vainqueur de ces playoffs est désigné Champion de France. L'équipe classée 16e de Pro A à l'issue de la saison régulière du championnat, descend en Pro B. Elle est remplacée par le club champion de France de Pro B. L'équipe classée 15e de Pro A à l'issue de la saison régulière du championnat dispute les barrages avec les équipes classées de 2 à 8 en Pro B.
Le tenant du titre, Pau-Orthez, va tenter de conserver son titre pour la troisième année consécutive.
Strasbourg et Châlons ont rejoint la Pro A à l’issue de la saison 1998-1999. Châlons, 16e de la saison régulière et Limoges sont relégués en Pro B. En effet, bien que Limoges ait remporté le titre de champion de France, le club, en proie à de graves problèmes financiers, est rétrogradé sur décision de la commission de gestion de la ligue.
La saison régulière a débuté le et s'est terminé le . Limoges a remporté le championnat pour la neuvième fois de son histoire en battant en finale l'ASVEL en trois manches.
Le match aller se joue chez l'équipe la mieux classée lors de la saison régulière, le match retour chez l'équipe la moins bien classée et la belle éventuelle chez l'équipe la mieux classée lors de la saison régulière[1].
Cette division a été appelée Excellence entre 1921 et 1949, Nationale entre 1949 et 1963, 1re Division en 1964 et 1965, Nationale 1 entre 1966 et 1987, Nationale 1A entre 1987 et 1992, Nationale A1 en 1992 et 1993, Pro A entre 1993 et 2018, Jeep Élite entre 2018 et 2021, Betclic Élite depuis 2021. En gris, les saisons où le championnat n'a pas eu lieu.
