Amar Ammour connaît sa première sélection en équipe nationale A d'Algérie le face à l'Ouganda, marquant à cette occasion son premier but en sélection. Ce milieu très technique ne participe qu'à peu de matchs avec son pays à cause de blessures répétitives.
Il commence le football à 18 ans au club de son village, le MCB Aïn Hadjel, avant de rejoindre le MC Alger en 1996, où il a passer deux saisons sans jouer beaucoup de matchs. Il change de club et joue au SA Mohamadia club de division 1, il rétrograde en division 2 à sa première saison et joue l'année suivante en D2, avant de rejoindre l'ASM Oran, où il a fait une excellente saison et devient l'un des meilleurs joueurs du championnat. Il rejoint l'USM Alger en juin 2002, où il explose en remportant un doublé historique à sa première saison en marquant dix buts en championnat et en remportant le Ballon d'Or algérien du Buteur et l'Étoile d'Or du meilleur joueur du championnat.
Après une année extraordinaire, Ammour déçoit pour sa seconde saison pour cause de blessures ; il remporte la coupe d'Algérie à la fin de la saison.
Ammour n'est pas au meilleur de son niveau pendant les saisons suivantes même si l'USM Alger écrase le championnat pendant la saison 2004-2005.
L'année suivante, le chouchou des Usmistes revient peu à peu à son meilleur niveau, il a fait une excellente fin de saison mais encore une fois l'USMA perd en finale de coupe d'Algérie contre le Mouloudia d'Alger ; c'est la deuxième saison que l'USMA n'a plus gagné de titres.
Les 2 années suivantes, Ammour est au meilleur de sa forme, il est l'un des meilleurs joueurs du pays mais sans pouvoir gagner de titres. Il quitte l'USM Alger pendant l'intersaison 2009 et signe chez le CA Bordj Bou Arreridj. Il passe une saison au CABBA où il fait quelques bonnes choses.
À la fin de la saison 2010-2011, il quitte le MCA pour rejoindre le Chabab Riadhi de Belouizdad et devient un élément important au sein de l’équipe type qui fait partie des prétendant pour remporter le championnat.
