D' à , il a été élève de l'école supérieure de pilotage militaire de Borisoglebsk et, de à , étudiant de l'école supérieure de pilotage militaire de Yelsk, où il a obtenu son diplôme de pilote-ingénieur.
Carrière comme pilote
D' à , il a été instructeur de pilote au sein du Régiment d'entraînement de l'aviation (TAR) de l'école de pilotage militaire supérieure de Yeisk. De à , il a été instructeur de pilotage puis commandant de l’Institut de l’aviation militaire de Krasnodar à Kotelnikovo (région de Volgograd). À partir de , et jusqu’à sélection comme cosmonaute, il a été commandant d’une unité d’aviation du 70e Régiment spécial d’aviation (OITAPON). Il cumule plus de 1300 heures de vol à bord des avions Yak-52 et L-39. Ovchinin possède le grade de deuxième classe d’instructeur pilote.
Par ordre du ministre de la Défense de la fédération de Russie en 2012, il a été renvoyé des forces armées en réserve.
Alexeï a été sélectionné en 2006 dans la sélection TsPK 14.
Alexeï s'envole le vers l'ISS à bord du Soyouz MS-10 avec Nick Hague et devait participer aux expéditions 57 et 58. Toutefois, une défaillance du lanceur Soyouz impose un retour dans l’atmosphère en mode balistique. Trente minutes après le décollage, l'équipage a atterri sain et sauf dans le Kazakhstan[1].