Après l'arrêt de Les Nuls L'émission, il apparaît dans Ce soir avec les Nouveaux où il continue d'écrire et d'interpréter des sketches. Il écrit ensuite pour l'émission Le Plein de Super animée par Yvan Le Bolloc'h et Bruno Solo, une émission se déroulant dans une voiture. En parallèle, il écrit pour l'émission Groland où il joue le rôle du reporter Fabien Julliard.
Entre 1995 et 1997, il coécrit avec Michel Hazanavicius le scénario du film Le Clone pour Élie et Dieudonné, sorti en juin 1998. En 1997, il anime également pendant deux mois un jeu télévisé sur France 2, Passe à ton voisin et écrit pour la presse, dans Infos du Monde nouvelle formule.
De 2001 à 2004, il incarne le rôle du comptable Sylvain Muller dans la série Caméra Café, diffusée sur M6 tout en continuant à écrire pour Arthur et d'autres animateurs.
En 2004, il écrit son one-man-show et tourne dans le film Espace Détente, la première adaptation de la série Caméra Café.
En 2005, il participe puis coanime avec Patrick Timsit et Jean-François Halin l'émission Radio Timsit sur Europe 2 pendant cinq semaines, de 9 h à 10 h. De à , il anime l'émission On ne plaisante pas toujours sur Europe 2, durant la matinale de la station (6-9 h).
De 2005 à 2013, il joue dans son one man show intitulé Conseils à des jeunes qui veulent rentrer dans le show-bizness, mis en scène par Jean-Philippe Daguerre.
Alexandre Pesle n'a pas joué dans le film Le Séminaire (2009) — la suite d'Espace Détente — à la suite de désaccords avec la production. Sylvain, son personnage, a alors été supprimé du scénario (un dialogue au début du film y fait référence ; Sylvain est mort dans un accident de la route). Bruno Solo avait annoncé qu'Alexandre Pesle était en tournée pour son spectacle et qu'il ne pouvait pas assurer le rôle, mais ce dernier a tout de suite démenti, dénigrant le scénario de ce deuxième opus de Caméra Café et en accusant la production de lui offrir un cachet trop bas. Cet épisode provoque une brouille durable entre les deux hommes[1][source insuffisante]. Mais, lors d'une interview en , Pesle affirme être de nouveau en bons termes avec Solo[2].
Depuis 2019, il joue dans son deuxième one man show intitulé Conseils à des jeunes qui veulent rire de tout, mis en scène par Caroline Mansard.
Il a été par trois fois candidat au jeu de France 2, Fort Boyard (en 1997, 2004 et 2011).