Susan Aho on kuulunut Värttinä-yhtyeeseen vuodesta 1997 ja Johanna Hytti vuodesta 2001. Kuunkuiskaajat perustettiin, kun Saksa–Suomi-seura etsi yksitoista tilaisuutta kestävälle Saksan-kiertueelle yhtyettä, joka esittäisi myös tangoa. Virtanen ja Aho totesivat pystyvänsä tähän ja lähtivät duona kiertueelle. Yhdistelmä toimi, ja Kuunkuiskaajat teki ensilevynsä, jonka oli tarkoitus ilmestyä elokuussa 2009. Pääsy euroviisukarsintoihin lykkäsi levyn ilmestymisen joulukuulle. Levyltä valittiin euroviisuehdokkaaksi Timo Kiiskisen kirjoittama kappale ”Työlki ellää”.[1] Kuunkuiskaajat julkaisivat vuonna 2016 toisen albuminsa Revitty rakkaus. Sen myötä duo myös lopetti toimintansa juhannuksena 2016.[2]
Toukokuussa 2023 Kuunkuiskaajat julkaisi oman "boomer-versioksi" luonnehditun parodian KäärijänCha cha cha -kappaleesta.[3]
