لیگ آزادگان ۹۹–۱۳۹۸ دومین لیگ معتبر فوتبال ایران است که در این دوره ۱۰ تیم از فصل گذشته به همراه سه تیم صعود کرده از لیگ دسته دوم فوتبال ایران و ۲ تیم سقوط کرده از لیگ برتر خلیج فارس و ۳ تیم که با خرید امتیاز به لیگ آزادگان راه پیدا کردند حضور دارند. بر اساس آئین‌نامه موجود در پایان هر فصل تیم‌های اول و دوم لیگ برتری می‌شوند و سه تیم انتهای جدول هم به دسته دوم سقوط خواهند کرد.تیم مس رفسنجان با ۶۶ امتیاز فاتح و قهرمان این دوره لیگ آزادگان شد. تیم های مس رفسنجان و آلومینیوم اراک به لیگ برتر صعود کردند همچنین تیم های علم و ادب تبریز و سپیدرود رشت و نیرو زمینی تهران با قرار گرفتن در پایین و قعر جدول لیگ دسته اول به لیگ دسته دوم سقوط کردند.
