Werner Schwarz wurde 1900 als Sohn eines Kaufmanns in Hamburg-Uhlenhorst geboren.[1] Nach dem Besuch des Gymnasiums in Hamburg-Bergedorf ging er 1917 auf die Handelsschule in Hamburg. 1918 nahm er noch als Soldat am Ersten Weltkrieg teil. Er absolvierte von 1918 bis 1922 eine landwirtschaftliche Ausbildung und studierte von 1922 bis 1925 Landwirtschaft. Ab 1926 war er selbständiger Landwirt auf Gut Frauenholz. Von 1948 bis 1959 war Schwarz zweiter Landesvorsitzender des Bauernverbandes Schleswig-Holstein und gleichzeitig Mitglied im Präsidium des Deutschen Bauernverbandes.
Werner Schwarz ist der Vater des schleswig-holsteinischen Landesministers Henning Schwarz (1928–1993), der 1987/1988 geschäftsführender Ministerpräsident von Schleswig-Holstein war und somit der Großvater der Politikerin Sabine Sütterlin-Waack (* 1958). Über seinen Sohn Günther (1928–2014), der von 1987 bis 1994 Bürgermeister der Gemeinde Rethwisch war, ist er Großvater des Bauernfunktionärs und Politikers Werner Schwarz (* 1960).[2] Zwei seiner Enkelkinder sind somit gleichzeitig schleswig-holsteinische Landesminister im Kabinett Günther II.
